East Asian-specific and cross-ancestry genome-wide meta-analyses provide mechanistic insights into peptic ulcer disease
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Peptic ulcer disease (PUD) refers to acid-induced injury of the digestive tract, occurring mainly in the stomach (gastric ulcer; GU) or duodenum (duodenal ulcer; DU). We conducted a large-scale cross-ancestry meta-analysis of PUD combining genome-wide association studies with four Japanese and two European studies (52,032 cases and 905,344 controls), and discovered 25 novel loci highly concordant across ancestries. Based on these loci, an examination of similarities and differences in genetic architecture between GU and DU demonstrated that GU shared the same risk loci as DU, although with smaller genetic effect sizes and higher polygenicity than DU, indicating higher heterogeneity of GU. H. pylori (HP)-stratified analysis found an HP-related host genetic locus, marking its role in HP-mediated PUD etiology. Integrative analyses using bulk and single-cell transcriptome profiles highlighted the genetic factors of PUD to be enriched in the highly expressed genes in stomach tissues, especially in somatostatin-producing D cells. Our results provide genetic evidence that gastrointestinal cell differentiations and hormone regulations are critical in PUD etiology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,008 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».