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Enregistrement W4307582719 · doi:10.1007/s00330-022-09179-3

Fully-automated deep learning-based flow quantification of 2D CINE phase contrast MRI

2022· article· en· W4307582719 sur OpenAlexafffund
Maurice Pradella, Michael Scott, Muhammad Omer, Seth K. Hill, Lisette Lockhart, Xin Yi, Alborz Amir-Khalili, Alireza Sojoudi, Bradley D. Allen, Ryan Avery, Michael Markl

Notice bibliographique

RevueEuropean Radiology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced MRI Techniques and Applications
Établissements canadiensCircle Cardiovascular Imaging
Organismes subventionnairesNorthwestern UniversityCircle Cardiovascular ImagingFreiwillige Akademische GesellschaftUniversität BaselAmerican Heart Association
Mots-clésMedicineNeuroradiologyNuclear medicinePhase contrast microscopyInterventional radiologyUltrasoundBlood flowRadiologyNeurology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Time-resolved, 2D-phase-contrast MRI (2D-CINE-PC-MRI) enables in vivo blood flow analysis. However, accurate vessel contour delineation (VCD) is required to achieve reliable results. We sought to evaluate manual analysis (MA) compared to the performance of a deep learning (DL) application for fully-automated VCD and flow quantification and corrected semi-automated analysis (corSAA). METHODS: We included 97 consecutive patients (age = 52.9 ± 16 years, 41 female) with 2D-CINE-PC-MRI imaging on 1.5T MRI systems at sinotubular junction (STJ), and 28/97 also received 2D-CINE-PC at main pulmonary artery (PA). A cardiovascular radiologist performed MA (reference) and corSAA (built-in tool) in commercial software for all cardiac time frames (median: 20, total contours per analysis: 2358 STJ, 680 PA). DL-analysis automatically performed VCD, followed by net flow (NF) and peak velocity (PV) quantification. Contours were compared using Dice similarity coefficients (DSC). Discrepant cases (> ± 10 mL or > ± 10 cm/s) were reviewed in detail. RESULTS: DL was successfully applied to 97% (121/125) of the 2D-CINE-PC-MRI series (STJ: 95/97, 98%, PA: 26/28, 93%). Compared to MA, mean DSC were 0.91 ± 0.02 (DL), 0.94 ± 0.02 (corSAA) at STJ, and 0.85 ± 0.08 (DL), 0.93 ± 0.02 (corSAA) at PA; this indicated good to excellent DL-performance. Flow quantification revealed similar NF at STJ (p = 0.48) and PA (p > 0.05) between methods while PV assessment was significantly different (STJ: p < 0.001, PA: p = 0.04). A detailed review showed noisy voxels in MA and corSAA impacted PV results. Overall, DL analysis compared to human assessments was accurate in 113/121 (93.4%) cases. CONCLUSIONS: Fully-automated DL-analysis of 2D-CINE-PC-MRI provided flow quantification at STJ and PA at expert level in > 93% of cases with results being available instantaneously. KEY POINTS: • Deep learning performed flow quantification on clinical 2D-CINE-PC series at the sinotubular junction and pulmonary artery at the expert level in > 93% of cases. • Location detection and contouring of the vessel boundaries were performed fully-automatic with results being available instantaneously compared to human assessments which approximately takes three minutes per location. • The evaluated tool indicates usability in daily practice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,875
Score d'incertitude au seuil0,455

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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