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Enregistrement W4307625960

Neural network and logistic regression diagnostic prediction models for giant cell arteritis: development and validation

2019· article· en· W4307625960 sur OpenAlexaboutno aff
Ing EB, Neil R. Miller, Angeline Nguyen, Su W, M Poole, Vinay Kansal, Andrew Toren, Dana Albreiki, Mouhanna JG, A Muladzanov, M Bernier, M Gans, C Wendel, C Sheldon, M Shields, Lorne Bellan, M Lee-Wing, Yasaman Mohadjer, Navdeep Nijhawan, Felix Tyndel, ten Hove MW, Chen Jj, Rodriguez AR, Hu Angang, Nader Khalidi, Royce Ing, Nurhan Torun

Notice bibliographique

RevueDOAJ (DOAJ: Directory of Open Access Journals) · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVasculitis and related conditions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLogistic regressionGiant cell arteritisArtificial neural networkArtificial intelligenceRegressionComputer scienceMachine learningStatisticsMedicineMathematicsPathologyDiseaseVasculitis
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Edsel B Ing,1 Neil R Miller,2 Angeline Nguyen,2 Wanhua Su,3 Lulu LCD Bursztyn,4 Meredith Poole,5 Vinay Kansal,6 Andrew Toren,7 Dana Albreki,8 Jack G Mouhanna,9 Alla Muladzanov,10 Mikaël Bernier,11 Mark Gans,10 Dongho Lee,12 Colten Wendel,13 Claire Sheldon,13 Marc Shields,14 Lorne Bellan,15 Matthew Lee-Wing,15 Yasaman Mohadjer,16 Navdeep Nijhawan,1 Felix Tyndel,17 Arun NE Sundaram,17 Martin W ten Hove,18 John J Chen,19 Amadeo R Rodriguez,20 Angela Hu,21 Nader Khalidi,21 Royce Ing,22 Samuel WK Wong,23 Nurhan Torun24 1Ophthalmology, University of Toronto, Toronto, ON, Canada; 2Ophthalmology, Johns Hopkins University, Baltimore, MD, USA; 3Statistics, MacEwan University, Edmonton, AB, Canada; 4Ophthalmology, Western University, London, ON, Canada; 5Queens University, Kingston, ON, Canada; 6Ophthalmology, University of Saskatchewan, Saskatoon, SK, Canada; 7Laval University, Quebec, QC, Canada; 8Ophthalmology, University of Ottawa, Ottawa, ON, Canada; 9University of Ottawa, Ottawa, ON, Canada; 10Ophthalmology, McGill University, Montreal, QC, Canada; 11University of Sherbrooke, QC, Canada; 12University of British Columbia, Vancouver, BC, Canada; 13Ophthalmology, University of British Columbia, Vancouver, BC, Canada; 14Ophthalmology, University of Virginia, Fisherville, VA, USA; 15Ophthalmology, University of Manitoba, Winnipeg, MB, Canada; 16Ophthalmology, Eye Institute of West Florida, Tampa, FL, USA; 17Neurology, University of Toronto, Toronto, ON, Canada; 18Ophthalmology, Queens University, Toronto, ON, Canada; 19Ophthalmology & Neurology, Mayo Clinic, Rochester, MN, USA; 20Ophthalmology, McMaster University, Hamilton, ON, Canada; 21Rheumatology, McMaster University, Hamilton, ON, Canada; 22Undergraduate Science, Ryerson University, Toronto, ON, Canada; 23Statistics, University of Waterloo, Waterloo, ON, Canada; 24Ophthalmology, Harvard University, Boston, MA, USA Purpose: To develop and validate neural network (NN) vs logistic regression (LR) diagnostic prediction models in patients with suspected giant cell arteritis (GCA). Design: Multicenter retrospective chart review.Methods: An audit of consecutive patients undergoing temporal artery biopsy (TABx) for suspected GCA was conducted at 14 international medical centers. The outcome variable was biopsy-proven GCA. The predictor variables were age, gender, headache, clinical temporal artery abnormality, jaw claudication, vision loss, diplopia, erythrocyte sedimentation rate, C-reactive protein, and platelet level. The data were divided into three groups to train, validate, and test the models. The NN model with the lowest false-negative rate was chosen. Internal and external validations were performed.Results: Of 1,833 patients who underwent TABx, there was complete information on 1,201 patients, 300 (25%) of whom had a positive TABx. On multivariable LR age, platelets, jaw claudication, vision loss, log C-reactive protein, log erythrocyte sedimentation rate, headache, and clinical temporal artery abnormality were statistically significant predictors of a positive TABx (P≤0.05). The area under the receiver operating characteristic curve/Hosmer–Lemeshow P for LR was 0.867 (95% CI, 0.794, 0.917)/0.119 vs NN 0.860 (95% CI, 0.786, 0.911)/0.805, with no statistically significant difference of the area under the curves (P=0.316). The misclassification rate/false-negative rate of LR was 20.6%/47.5% vs 18.1%/30.5% for NN. Missing data analysis did not change the results.Conclusion: Statistical models can aid in the triage of patients with suspected GCA. Misclassification remains a concern, but cutoff values for 95% and 99% sensitivities are provided (https://goo.gl/THCnuU). Keywords: giant cell arteritis, temporal artery biopsy, neural network, logistic regression, prediction models, ophthalmology, rheumatology

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,020
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,053
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,104

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0200,053
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,168
Tête enseignante GPT0,464
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2019
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