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Enregistrement W4307715779 · doi:10.1038/s41561-022-01053-7

Declining metal availability in the Mesozoic seawater reflected in phytoplankton succession

2022· article· en· W4307715779 sur OpenAlexaff
Qiong Zhang, El Mahdi Bendif, Yu Zhou, Bruno Nevado, Roxana Shafiee, Rosalind E. M. Rickaby

Notice bibliographique

RevueNature Geoscience · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiquePaleontology and Stratigraphy of Fossils
Établissements canadiensUniversité du Québec à Rimouski
Organismes subventionnairesStanford Bio-XUniversità degli Studi di Firenze
Mots-clésPhytoplanktonEcological successionTrace metalSeawaterMesozoicBiotaOceanographyTrace elementEcologyNutrientEnvironmental chemistryGeologyBiologyPaleontologyChemistryMetalGeochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Variable trace metal concentrations in the Precambrian ocean were closely linked to oxygen availability, although less is known about the drivers of seawater trace metal chemistry after the spread of complex life into the Phanerozoic eon. A major phytoplankton succession took place at the transition from the Palaeozoic to the Mesozoic era (~250 Myr ago), from an ocean dominated by the green Archaeplastida to secondary endosymbiotic algae with red-algal-derived plastids. Here, our comparative genomic analysis of 26 complete proteomes and metal domain analysis of additional 608 partially complete sequences of phytoplankton reveal that groups with different evolutionary history have distinct metal-binding proteins and contrasting metal acquisition strategies, adapted to differing availability of trace metals. The secondary-endosymbiont-bearing lineages are better adapted to well-oxygenated, nutrient-poor environments. This is supported by an enhanced thiol-based binding affinity of their transporters, coupled with minimized proteomic requirement for trace elements such as iron, copper and zinc at both protein and domain levels. Such different metal requirements across these lineages suggest a drastic decline in open-ocean trace metal concentrations at the inception of the Mesozoic, contributing to the shifts in phytoplankton communities that drove major changes in ocean chemical buffering.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,989

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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