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Enregistrement W4307835686 · doi:10.1177/09622802221134172

Bayesian inference for Cox proportional hazard models with partial likelihoods, nonlinear covariate effects and correlated observations

2022· article· en· W4307835686 sur OpenAlexaff
Ziang Zhang, Alex Stringer, Patrick Brown, James E. Stafford

Notice bibliographique

RevueStatistical Methods in Medical Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueStatistical Methods and Bayesian Inference
Établissements canadiensCentre for Global Health ResearchSt. Michael's HospitalUniversity of WaterlooUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCovariateLaplace's methodMarkov chain Monte CarloBayesian probabilityInferenceParametric statisticsProportional hazards modelComputer scienceBayesian inferenceMathematicsEconometricsApplied mathematicsStatisticsAlgorithmArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We propose a flexible and scalable approximate Bayesian inference methodology for the Cox Proportional Hazards model with partial likelihood. The model we consider includes nonlinear covariate effects and correlated survival times. The proposed method is based on nested approximations and adaptive quadrature, and the computational burden of working with the log-partial likelihood is mitigated through automatic differentiation and Laplace approximation. We provide two simulation studies to show the accuracy of the proposed approach, compared with the existing methods. We demonstrate the practical utility of our method and its computational advantages over Markov Chain Monte Carlo methods through the analysis of Kidney infection times, which are paired, and the analysis of Leukemia survival times with a semi-parametric covariate effect and spatial variation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,034
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,054

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,034
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,235
Tête enseignante GPT0,541
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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