Mycn regulates intestinal development through ribosomal biogenesis in a zebrafish model of Feingold syndrome 1
Notice bibliographique
Résumé
Feingold syndrome type 1, caused by loss-of-function of MYCN, is characterized by varied phenotypes including esophageal and duodenal atresia. However, no adequate model exists for studying the syndrome's pathological or molecular mechanisms, nor is there a treatment strategy. Here, we developed a zebrafish Feingold syndrome type 1 model with nonfunctional mycn, which had severe intestinal atresia. Single-cell RNA-seq identified a subcluster of intestinal cells that were highly sensitive to Mycn, and impaired cell proliferation decreased the overall number of intestinal cells in the mycn mutant fish. Bulk RNA-seq and metabolomic analysis showed that expression of ribosomal genes was down-regulated and that amino acid metabolism was abnormal. Northern blot and ribosomal profiling analysis showed abnormal rRNA processing and decreases in free 40S, 60S, and 80S ribosome particles, which led to impaired translation in the mutant. Besides, both Ribo-seq and western blot analysis showed that mTOR pathway was impaired in mycn mutant, and blocking mTOR pathway by rapamycin treatment can mimic the intestinal defect, and both L-leucine and Rheb, which can elevate translation via activating TOR pathway, could rescue the intestinal phenotype of mycn mutant. In summary, by this zebrafish Feingold syndrome type 1 model, we found that disturbance of ribosomal biogenesis and blockage of protein synthesis during development are primary causes of the intestinal defect in Feingold syndrome type 1. Importantly, our work suggests that leucine supplementation may be a feasible and easy treatment option for this disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».