Metastasis in endometriosis: targeted sequencing suggests non-malignancy associated endometriosis is capable of wide dissemination
Notice bibliographique
Résumé
Objective Multiple forms of endometriosis have been shown to harbour somatic cancer-driver alterations. Previous studies have focused on the inter-patient heterogeneity of genetic alterations in endometriosis, analyzing lesions collected from the same anatomical types of endometriosis across different patients. The aim of our study was to explore intra-patient heterogeneity and potential clonal relationships of multiple anatomically separated lesions of distinct types of endometriosis within a given patient. Materials and methods We examined endometriosis lesions of patients with multiple anatomically separated lesions, and each having at least two distinct types of endometriosis. Samples were assayed with a high sensitivity targeted sequencing panel and findings validated with droplet digital PCR and mutation-surrogate immunohistochemistry. Results 73 endometriosis lesions from 27 patients were analyzed. Results found 13/27 patients had informative somatic driver mutation in endometriosis, of these 9/13 had identical mutations across distinct lesions. Endometriomas showed a higher mutational complexity, with functionally redundant driver mutations within the same gene. Conclusions Our data are consistent with clonality across endometriosis lesions regardless of subtype. Further the finding of redundancy in mutations with the same gene and lesions is also consistent with endometriosis representing an oligoclonal disease with dissemination likely to consist of multiple epithelial clones travelling together. This suggests the current anatomically defined classification of endometriosis does not fully recognize the etiology of the disease. A novel classification should consider genomic and other molecular features. These findings could further contribute to the development of a more personalized endometriosis diagnosis and care. Publication History Article published online: 11 October 2022 © 2022. Thieme. All rights reserved. Georg Thieme Verlag Rüdigerstraße 14, 70469 Stuttgart, Germany
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».