Urinary Eubacterium sp. CAG:581 promotes non-muscle-invasive bladder cancer (NMIBC) development through ECM1/MMP9 pathway
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background: Increasing evidence points to the urinarymicrobiota as a possible key susceptibility factor for early-stage bladder cancer(BCa) progression. However, its underlying mechanism interpretation is often insufficient, given that various environmental conditions have affected the composition of urinary microbiota. Herein, we sought to rule out confounding factors and clarify how urinary Eubacterium sp. CAG:581 promoted non-muscle-invasive bladder cancer (NMIBC) development. Methods: Differentially abundant urinary microbiota of 51 NMIBC patients and 47 healthy controls as the Cohort 1 were firstly determined by metagenomics analysis. Then we modeled the coculture of NMIBC organoids with candidate urinary Eubacterium sp. CAG:581 in anaerobic condition and explored differentially expressed genes of NMIBC organoids by RNA-Seq. Furthermore, we dissected the mechanisms involved into Eubacterium sp. CAG:581-induced extracellular matrix protein 1 (ECM1) and matrix metalloproteinase 9 (MMP9) upregulation. Finally, we used multivariate Cox modeling to investigate the clinical relevance of urinary Eubacterium sp. CAG:581 16S ribosomal RNA (16SrRNA) levels with the prognosis of 406 NMIBC patients as the Cohort 2. Results: Eubacterium sp. CAG:581infection accelerated the proliferation of NMIBC organoids (P < 0.01); ECM1 and MMP9 were the most upregulated gene induced by increased colony forming units (CFU) gradient of Eubacterium sp. CAG:581 infection, via phosphorylating ERK1/2 in NMIBC organoids of the Cohort 1. Excluding the favorable impact of potential contributing factors, ROC curve of the Cohort 2 manifested its 3-year AUC value as 0.79 and the cut-off point of Eubacterium sp. CAG:581 16SrRNA as 10.3 (delta CT value). Conclusion: Our evidence suggests that urinary Eubacterium sp. CAG:581 promoted NMIBC progression through ECM1/MMP9 pathway, which may serve as the promising noninvasive diagnostic biomarker for NMIBC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».