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Enregistrement W4307931662 · doi:10.32920/21288267

Cross Attention Squeeze Excitation Network (CASE-Net) for Whole Body Fetal MRI Segmentation

2022· preprint· en· W4307931662 sur OpenAlexafffund
Justin H. Lo, Saiee Nithiyanathan, Jillian Cardinell, Dylan M. Young, Sherwin Cho, Abirami Kirubarajan, Matthias Wagner, Roxana Azma, S. D. Miller, Mike Seed, Birgit Ertl‐Wagner, Dafna Sussman

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFetal and Pediatric Neurological Disorders
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoToronto Metropolitan UniversitySt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaHospital for Sick Children
Mots-clésSegmentationComputer scienceArtificial intelligenceMagnetic resonance imagingDeep learningImage segmentationProcess (computing)Pattern recognition (psychology)Machine learningMedicineRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Segmentation of the fetus from 2-dimensional (2D) magnetic resonance imaging (MRI) can aid radiologists with clinical decision making for disease diagnosis. Machine learning can facilitate this process of automatic segmentation, making diagnosis more accurate and user independent. We propose a deep learning (DL) framework for 2D fetal MRI segmentation using a Cross Attention Squeeze Excitation Network (CASE-Net) for research and clinical applications. CASE-Net is an end-to-end segmentation architecture with relevant modules that are evidence based. The goal of CASE-Net is to emphasize localization of contextual information that is relevant in biomedical segmentation, by combining attention mechanisms with squeeze-and-excitation (SE) blocks. This is a retrospective study with 34 patients. Our experiments have shown that our proposed CASE-Net achieved the highest segmentation Dice score of 87.36%, outperforming other competitive segmentation architectures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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