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Enregistrement W4307945778 · doi:10.3390/ijms232113153

Differential Response of Transcription Factors to Activated Kinases in Steroidogenic and Non-Steroidogenic Cells

2022· article· en· W4307945778 sur OpenAlexafffund
Kenley Joule Pierre, Jacques Tremblay

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNuclear Receptors and Signaling
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMcKnight Foundation
Mots-clésKinaseTransactivationCell biologyTranscription factorBiologyProtein kinase AGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hormone-induced Leydig cell steroidogenesis requires rapid changes in gene expression in response to various hormones, cytokines, and growth factors. These proteins act by binding to their receptors on the surface of Leydig cells leading to activation of multiple intracellular signaling cascades, downstream of which are several kinases, including protein kinase A (PKA), Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase I (CAMKI), and extracellular signal-regulated protein kinase 1 and 2 (ERK1/2). These kinases participate in hormone-induced steroidogenesis by phosphorylating numerous proteins including transcription factors leading to increased steroidogenic gene expression. How these various kinases and transcription factors come together to appropriately induce steroidogenic gene expression in response to specific stimuli remains poorly understood. In the present work, we compared the effect of PKA, CAMKI and ERK1/2 on the transactivation potential of 15 transcription factors belonging to 5 distinct families on the activity of the Star gene promoter. We not only validated known cooperation between kinases and transcription factors, but we also identified novel cooperations that have not yet been before reported. Some transcription factors were found to respond to all three kinases, whereas others were only activated by one specific kinase. Differential responses were also observed within a family of transcription factors. The diverse response to kinases provides flexibility to ensure proper genomic response of steroidogenic cells to different stimuli.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,295

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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