MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4307998948 · doi:10.3389/fsysb.2022.926923

Dual continuum upscaling of liver lobule flow and metabolism to the full organ scale

2022· article· en· W4307998948 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Systems Biology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueMathematical Biology Tumor Growth
Établissements canadiensUniversity of AlbertaMacEwan UniversityVirtual Materials Group (Canada)
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMacEwan University
Mots-clésDiscretizationLobules of liverGridMechanicsBiological systemPhysicsGeometryMathematicsBiologyMathematical analysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The liver is the body’s primary metabolic organ and its functions operate at multiple time and spatial scales. Here we employ multiscale modelling techniques to describe these functions consistently, based on methods originally developed to describe reactive fluid flow processes in naturally-fractured geological sediments. Using a fully discretized idealized lobule model for flow and metabolism, a dual continuum approach is developed in two steps: 1) Two interacting continua models for tissue and sinusoids properties, followed by 2) further upscaled dual continua models leading to an averaged lobule representation. Results (flows, pressures, concentrations, and reactions) from these two approaches are compared with our original model, indicating the equivalences and approximations obtained from this upscaling for flow, diffusion, and reaction parameters. Next, we have generated a gridded dual continuum model of the full liver utilizing an innovative technique, based on published liver outline and vasculature employing a vasculature generation algorithm. The inlet and outlet vasculature systems were grouped into five generations each based on radius size. With a chosen grid size of 1 mm 3 , our resulting discretized model contains 3,291,430 active grid cells. Of these cells, a fraction is occupied vasculature, while the dominant remaining fraction of grid cells approximates liver lobules. Here the largest generations of vasculature occupy multiple grid cells in cross section and length. The lobule grid cells are represented as a dual continuum of sinusoid vasculature and tissue. This represents the simplest gridded dual continuum representation of the full liver organ. With this basic model, numerous full liver drug metabolism simulations were run. A non-reactive PAC (paclitaxel) injection case including only convective transfer between vasculature and tissue was compared with including an additional diffusive transfer mechanism. These two cases were then rerun with tissue reaction, converting injected PAC to PAC-OH (6-hydroxypaclitaxel). There was little transfer of PAC from vasculature to tissue without the addition of diffusive transfer, and this had a significant observable effect on internal PAC distribution in the absence of reaction, and also on the distribution of PAC-OH for the reactive cases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,107
Score d'incertitude au seuil0,527

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle