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Enregistrement W4308133047 · doi:10.1210/jendso/bvac150.283

RF21 | PSUN07 Germline Genetic Testing in a Cohort of Adults with Adrenocortical Carcinoma : Insights From a Clinical Care Setting

2022· article· en· W4308133047 sur OpenAlexaboutno aff
Aurélie Mourot, Stéfanie Parisien‐La Salle, Jonathan Poirier, Harold J. Olney, André Lacroix, Zaki E Haffaf, Isabelle Bourdeau

Notice bibliographique

RevueJournal of the Endocrine Society · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdrenal and Paraganglionic Tumors
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenetic testingAdrenocortical carcinomaMedicineMSH6CHEK2Genetic counselingMSH2Context (archaeology)Lynch syndromeGermlineOncologyGermline mutationCancerInternal medicineGeneticsColorectal cancerBiologyDNA mismatch repairMutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Context About 5-10% of adrenocortical cancer (ACC) arise in patients with genetic predisposition syndromes, including Li-Fraumeni, Lynch, MEN1, or Familial Adenomatous Polyposis (APC). Recent European (2018) and American guidelines (2020) recommend that all adults with ACC should be offered clinical genetic counseling. There is a paucity of data regarding systematic germline testing in adults with ACC and the extent of the genetic evaluation is unclear. Objective To describe the germline genetic characteristics in a cohort of adult patients with ACC evaluated in a tertiary clinical care center. Methods Data including demographics, personal and family history of neoplasia, pathology reports, clinical features and genetic testing were retrospectively collected from charts of patients treated at Centre hospitalier de l'Université de Montréal (CHUM). After genetic counseling, genetic testing was proposed to patients with a pathologic diagnosis of ACC. From 2005 to 2015, TP53 gene analysis was performed using direct sequencing and MLPA. Since 2016, multigene testing was performed for a progressively increasing number of oncogenic genes using a custom next-generation panel for germline leucocyte DNA including at least the TP53, MSH2, MSH6, MLH1,PMS2, EPCAM, MEN1, BRCA1 and BRCA2 genes (Invitae, CA). An extended panel, based on past medical and familial history, was performed at the discretion of the geneticist. Patient data was retrospectively investigated. Results We analyzed data from 44 patients with available germline genetic results. Median age of the patients was 46 years (ranging from 22 to 79 years), including 11 males (25.0%) and 33 females (75.0%). Ten patients (22.7%) underwent only TP53 gene analysis and 32 patients (72.7%) were studied using the larger oncogenic genetic panel. Germline pathogenic or likely pathogenic variants were identified in 5 of the 44 patients (11.4%) while genetic variants of unknown significance (VUS) were found in 7 of the 44 patients (15.9%). Among patients with pathogenic variants, one had a family history and known germline mutation in the BRCA2 gene (8765delAG, p.Glu2846GlyfsX23). One patient had a personal and familial medical history suggesting a MEN1 syndrome that was confirmed with the finding of a germline MEN1 mutation (c.1556delC, p.Pro519Leu fs40). Unsuspected germline pathogenic variants were found in three patients: 1) TP53 (c.425delC, p.Pro142fs), 2) MUTYH (c.536A>G, p.Tyr179Cys) and 3) MSH6 (c.3649-3655, p.Arg1217Leu fs9) genes. Variants of unknown significance (VUS) were found in the following genes: POT1, MSH3, PALB2, RAD51d, APC, ATM and BRCA2. Conclusions Germline pathogenic variants were found in 11.4% of our cohort of patients with ACC. VUS were found in 15.9% of patients but their significance remains to be determined. Genetic counseling and germline genetic testing should be offered to all patients with ACC; however the optimal use and extent of oncogenic gene panels need to be better defined. Presentation: Sunday, June 12, 2022 12:30 p.m. - 2:30 p.m., Sunday, June 12, 2022 12:48 p.m. - 12:53 p.m.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,522

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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