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Enregistrement W4308144426 · doi:10.1093/braincomms/fcac256

Distribution of acid-sensing ion channel subunits in human sensory neurons contrasts with that in rodents

2022· article· en· W4308144426 sur OpenAlexafffund
Melina Papalampropoulou-Tsiridou, Stephanie Shiers, Feng Wang, Antoine G. Godin, Theodore J. Price, Yves De Koninck

Notice bibliographique

RevueBrain Communications · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensUniversité LavalInstitut Universitaire en Santé Mentale de Québec
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésAcid-sensing ion channelBiologyNociceptorNeuroscienceIon channelDorsal root ganglionAlternative splicingIn situ hybridizationSensory systemCell biologyGene isoformReceptorGene expressionNociceptionGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Acid-sensing ion channels (ASICs) play a critical role in nociception in human sensory neurons. Four genes (ASIC1, ASIC2, ASIC3, and ASIC4) encoding multiple subunits through alternative splicing have been identified in humans. Real time-PCR experiments showed strong expression of three subunits ASIC1, ASIC2, and ASIC3 in human dorsal root ganglia; however, their detailed expression pattern in different neuronal populations has not been investigated yet. In the current study, using an in situ hybridization approach (RNAscope), we examined the presence of ASIC1, ASIC2, and ASIC3 mRNA in three subpopulations of human dorsal root ganglia neurons. Our results revealed that ASIC1 and ASIC3 were present in the vast majority of dorsal root ganglia neurons, while ASIC2 was only expressed in less than half of dorsal root ganglia neurons. The distribution pattern of the three ASIC subunits was the same across the three populations of dorsal root ganglia neurons examined, including neurons expressing the REarranged during Transfection (RET) receptor tyrosine kinase, calcitonin gene-related peptide, and a subpopulation of nociceptors expressing Transient Receptor Potential Cation Channel Subfamily V Member 1. These results strongly contrast the expression pattern of Asics in mice since our previous study demonstrated differential distribution of Asics among the various subpopulation of dorsal root ganglia neurons. Given the distinct acid-sensitivity and activity dynamics among different ASIC channels, the expression differences between human and rodents should be taken under consideration when evaluating the translational potential and efficiency of drugs targeting ASICs in rodent studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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