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Enregistrement W4308198947 · doi:10.22541/au.166756160.06302359/v1

Germline PDGFRB p.R987W pathogenic variant in two children with brain tumors

2022· preprint· en· W4308198947 sur OpenAlexafffund
HyeRim Han, Samuele Renzi, Valérie Larouche, Damien Faury, Sylvie Langlois, Daniel Sinnett, Andrea Gomez, Jason Karamchandani, Louis Crevier, William D. Foulkes, Nada Jabado

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMedical Imaging and Pathology Studies
Établissements canadiensMcGill University Health CentreUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineMcGill UniversityUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchGeneralitat de Catalunya
Mots-clésPDGFRBGermlineMedulloblastomaMedicineGliomaBiologyCancer researchPathologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Platelet-Derived Growth Factor Receptor Beta (PDGFRB) is critically implicated in development. Germline pathogenic variants (GPVs) in PDGFRB result in several distinct inherited syndromes including primary familial brain calcifications (PFBC) and infantile myofibromatosis. To date, GPVs in PDGFRB have not been identified in children with brain tumors. Here, we describe the clinicopathological features of a 9-year-old male with a medulloblastoma and an 11-year-old female with a glioma. Sequencing of the blood and tumor samples revealed the same PDGFRB c.2959C>T (p. Arg987Trp) GPV in both children. Additional fusion genes DCTN1-ALK and TRIM24-MET were also identified in the patients’ tumors through RNAseq.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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