MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4308254894 · doi:10.1007/s11259-022-10029-2

Growth charts for small sample sizes using unsupervised clustering: Application to canine early growth

2022· article· en· W4308254894 sur OpenAlexaboutno aff
Gabriel Kocevar, Maxime Rioland, Jérémy Laxalde, Amélie Mugnier, A Adib-Lesaux, Virginie Gaillard, Jonathan Bodin

Notice bibliographique

RevueVeterinary Research Communications · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesRoyal Canin
Mots-clésBreedCluster analysisScale (ratio)Cluster (spacecraft)Sample (material)Sample size determinationStatisticsBiologyMathematicsComputer scienceAnimal scienceCartographyGeography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Breed-specific growth curves (GCs) are needed for neonatal puppies, but breed-specific data may be insufficient. We investigated an unsupervised clustering methodology for modeling GCs by augmenting breed-specific data with data from breeds having similar growth profiles. Puppy breeds were grouped by median growth profiles (bodyweights between birth and Day 20) using hierarchical clustering on principal components. Median bodyweights for breeds in a cluster were centered to that cluster's median and used to model cluster GCs by Generalized Additive Models for Location, Shape and Scale. These were centered back to breed growth profiles to produce cluster-scale breed GCs. The accuracy of breed-scale GCs modeled with breed-specific data only and cluster-scale breed GCs were compared when modeled from diminishing sample sizes. A complete dataset of Labrador Retriever bodyweights (birth to Day 20) was split into training (410 puppies) and test (460 puppies) datasets. Cluster-scale breed and breed-scale GCs were modelled from defined sample sizes from the training dataset. Quality criteria were the percentages of observed data in the test dataset outside the target growth centiles of simulations. Accuracy of cluster-scale breed GCs remained consistently high down to sampling sizes of three. They slightly overestimated breed variability, but centile curves were smooth and consistent with breed-scale GCs modeled from the complete Labrador Retriever dataset. At sampling sizes ≤ 20, the quality of breed-scale GCs reduced notably. In conclusion, GCs for neonatal puppies generated using a breed-cluster hybrid methodology can be more satisfactory than GCs at purely the breed level when sample sizes are small.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,026
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,073
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,135

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0260,073
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,178
Tête enseignante GPT0,384
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueVeterinary Research CommunicationsMême sujetGenetic and phenotypic traits in livestockTravaux en français237 207