MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4308371201 · doi:10.1152/ajpcell.00364.2022

Identification of underexplored mesenchymal and vascular-related cell populations in human skeletal muscle

2022· article· en· W4308371201 sur OpenAlex
Alasdair Cameron, Griffen Wakelin, Nicholas Gaulton, Laura V. Young, Scott Wotherspoon, Nathan Hodson, Matthew Lees, Daniel R. Moore, Adam P. W. Johnston

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Cell Physiology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensDalhousie UniversityUniversity of TorontoUniversity of Prince Edward Island
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Canada
Mots-clésSkeletal musclePericyteBiologyMyocyteCell biologyMesenchymal stem cellProgenitor cellEndothelial stem cellCellCell typeStromal cellVascular smooth muscleStem cellAnatomyGeneticsCancer researchEndocrinologyIn vitroSmooth muscle

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Skeletal muscle repair and maintenance are directly and indirectly supported by interstitial cell populations such as vascular cells and fibro-adipogenic progenitors (FAPs), a subset of which express Twist2 and possess direct myogenic potential. Furthermore, work in rodents has highlighted the potential of pericytes to act as progenitor cells, giving rise to muscle cells and transdifferentiating into endothelial cells. However, less is understood about these populations in human skeletal muscle. Here, we performed single-cell RNA sequencing (scRNAseq) on ∼2,000 cells isolated from the human semitendinosus muscle of young individuals. This demonstrated the presence of a vascular-related cell type that expressed pericyte and pan-endothelial genes that we localized to large blood vessels within skeletal muscle cross sections and termed endothelial-like pericytes (ELPCs). RNA velocity analysis indicated that ELPCs may represent a “transition state” between endothelial cells and pericytes. Analysis of published scRNAseq data sets revealed evidence for ELPCs in trunk and heart musculature, which showed transcriptional similarity. In addition, we identified a subset of FAPs expressing TWIST2 mRNA and protein. Human TWIST2-expressing cells were anatomically and transcriptionally comparable to mouse Twist2 cells as they were restricted to the myofiber interstitium, expressed fibrogenic genes but lacked satellite cell markers, and colocalized with the FAPs marker PDGFRα in human muscle cross sections. Taken together, these results highlight the complexity of stromal cells residing in human skeletal muscle and support the utility of scRNAseq for discovery and characterization of poorly described cell populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,514
Score d'incertitude au seuil0,732

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle