Landscape-scale exposure to multiazole-resistant <i>Aspergillus fumigatus</i> bioaerosols
Notice bibliographique
Résumé
Abstract We demonstrate country-wide exposures to aerosolized spores of a human fungal pathogen, Aspergillus fumigatus , that has acquired resistance to first line azole clinical antifungal drugs. Assisted by a network of citizen scientists across the United Kingdom, we show that 1 in 20 viable aerosolized spores of this mold are resistant to the agricultural fungicide tebuconazole and 1 in 140 spores are resistant to the four most used azoles for treating clinical aspergillosis infections. Season and proximity to industrial composters were associated with growth of A. fumigatus from air samples, but not with the presence of azole resistance, and hotspots were not stable between sampling periods suggesting a high degree of atmospheric mixing. Genomic analysis shows no distinction between those resistant genotypes found in the environment and in patients, indicating that ~40% (58/150 sequenced genomes) of azole-resistant A. fumigatus infections are acquired from environmental exposures. Due to the ubiquity of this measured exposure, it is crucial that we determine source(s) of azole-resistant A. fumigatus , who is at greatest risk of exposure and how to mitigate these exposures, in order to minimize treatment failure in patients with aspergillosis. One sentence summary UK-wide citizen science surveillance finds a ubiquitous exposure to aerosolized spores of a human fungal pathogen that have evolved in the environment cross-resistance to essential clinical antifungal drugs
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».