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Enregistrement W4308423736 · doi:10.19044/esipreprint.10.2022.p895

First Isolation and Identification of Agriphages in Vegetable Crops in West Africa (Côte d’Ivore): Potential Uses of Biocontrol in Plants

2022· article· en· W4308423736 sur OpenAlexfundno aff
Adioumani Emmanuella, Kakou-Ngazoa Solange, Thibaud Martin, Trébissou Jonhson Noel David, Koudou Aristide, Sina K. Mireille, Sina Aoussi, Mireille Dosso

Notice bibliographique

RevueEuropean Scientific Journal ESJ · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversité Laval
Mots-clésBiologyRAPDRalstonia solanacearumBiological pest controlBiopesticideCropIsolation (microbiology)BacteriaXanthomonasRalstoniaMicrobiologyXanthomonas campestrisHorticultureBotanyPathogenAgronomyGenetic diversityPesticide

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Agriphages or bacterial viruses are ubiquitous in the environment. The discovery of virulent phages against phytobacteria improves crop growth and proposes biopesticide uses for plant diseases. In Africa, many phytobacteria like Ralstonia, Clavibacter, and Xanthomonas were reported in several regions. The study aims to evaluate the presence of agriphages for the biocontrol of phytobacteria in Côte d'Ivoire. Leaves and soil samples were collected from healthy and diseased plants, and in three sites located in Anyama, Abidjan, and Bingerville. The pretreatments occur with sterile and physiological water for leaves and soil samples respectively. The isolation of agriphages was done on specific media with Xanthomonas campestris as bacterial host. Lytic activity was tested on agar media for five bacteria strains. After DNA extraction using the Qiagen method kit, molecular confirmation of agriphages was done by Random Amplified Polymorphic DNA-PCR. From this study, five (5) agriphages were isolated in soil and leaves in site 2. These agriphages have all been isolated from Xanthomonas campestris and have a broad spectrum of lytic activity. Molecular characterization by RAPD-PCR showed that three of these agriphages are DNA phages. The dendrogram showed that phages ΦXanS1, ΦXanS2 have 93% similarities. While ΦXanS1 and ΦXanS2 are 62% similar to ΦXanF1. This study is the first reported agriphages in West Africa and their potential uses against phytobacteria for biocontrol infection in crops.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,886
Score d'incertitude au seuil0,222

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,194
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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