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Enregistrement W4308440027 · doi:10.26434/chemrxiv-2022-qggs2

The internal structure of the velvet worm projectile slime: A small-angle scattering study

2022· preprint· en· W4308440027 sur OpenAlexafffund
Alexander B. Baer, Ingo Hoffmann, Najet Mahmoudi, Alexandre Poulhazan, Matthew J. Harrington, Georg Mayer, Stephan Schmidt, Emanuel Schneck

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMax-Planck-GesellschaftDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésNeutron scatteringFiberScatteringSlime moldSmall-angle neutron scatteringCore (optical fiber)ChemistryChemical engineeringChemical physicsMaterials scienceNanotechnologyBiophysicsComposite materialOpticsBiologyPhysicsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Velvet worms capture prey and defend themselves by ejecting an adhesive slime which has been established as a model system for recyclable complex liquids. Triggered by mechanical agitation, the sticky fluid rapidly transitions into solid fibers. The assembly of slime proteins into stiff polymers is fully reversible and recyclable enabling the recovery of the soluble precursors. In order to understand the rapid and reversible mechanoresponsive behavior of this material, here, we study the nanostructural organization of slime components using small-angle scattering with neutrons and x-rays under physiological native conditions, after drying and re-hydration, and mechanical agitation. The scattering intensities are successfully described with a three-component model accounting for proteins of two dominant molecular weight fractions and for protein-based nanoglobules with a radius of ~40-45 nm, which is in line with the literature. However, in contrast to the previous assumption that high molecular weight (HMW) proteins -- the presumed building blocks of the fiber core -- are contained in the nanoglobules, we find that the majority of slime proteins exist as free proteins in solution, including the HMW fiber core precursors. Only less than 10 % of the slime proteins are contained in the nanoglobules, necessitating a reassessment of the previously proposed function of nanoglobules in fiber formation. Exploiting distinct differences in the x-ray and neutron scattering contrast of slime re-hydrated with light and heavy water (D2O) indicates that the majority of lipids available in the slime are contained in the nanoglobules, where they are homogeneously distributed. Surprisingly, mechanical agitation of slime in a completely filled container causes gelification; however, this neither leads to fiber formation nor alters the bulk structure of the slime significantly, suggesting that interfacial phenomena and directional shearing are required for the formation of stiff fibers in velvet worm slime.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,063
Score d'incertitude au seuil0,559

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,003
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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