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Enregistrement W4308681804 · doi:10.1080/22221751.2022.2146538

Structural insights into broadly neutralizing antibodies elicited by hybrid immunity against SARS-CoV-2

2022· article· en· W4308681804 sur OpenAlexaff
Mengxiao Luo, Biao Zhou, Eswar R. Reddem, Bingjie Tang, Bo‐Hao Chen, Runhong Zhou, Hang Liu, Lihong Liu, Phinikoula S. Katsamba, Ka‐Kit Au, Hiu-On Man, Kelvin Kai‐Wang To, Kwok‐Yung Yuen, Lawrence Shapiro, Shangyu Dang, David D. Ho, Zhiwei Chen

Notice bibliographique

RevueEmerging Microbes & Infections · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensColumbia College
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaHealth and Medical Research FundScience, Technology and Innovation Commission of Shenzhen MunicipalityInnovation and Technology Commission - Hong KongFood and Health BureauHong Kong University of Science and TechnologyBasic and Applied Basic Research Foundation of Guangdong ProvinceWellcomeResearch Grants Council, University Grants CommitteeWellcome Trust
Mots-clésAntibodyHomogeneousVirologyPotencyEpitopeBiologyImmunityNeutralizationComputational biologyNeutralizing antibodyImmunologyGeneticsImmune systemIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Increasing spread by SARS-CoV-2 Omicron variants challenges existing vaccines and broadly reactive neutralizing antibodies (bNAbs) against COVID-19. Here we determine the diversity, potency, breadth and structural insights of bNAbs derived from memory B cells of BNT162b2-vaccinee after homogeneous Omicron BA.1 breakthrough infection. The infection activates diverse memory B cell clonotypes for generating potent class I/II and III bNAbs with new epitopes mapped to the receptor-binding domain (RBD). The top eight bNAbs neutralize wildtype and BA.1 potently but display divergent IgH/IgL sequences and neuralization profiles against other variants of concern (VOCs). Two of them (P2D9 and P3E6) belonging to class III NAbs display comparable potency against BA.4/BA.5, although structural analysis reveals distinct modes of action. P3E6 neutralizes all variants tested through a unique bivalent interaction with two RBDs. Our findings provide new insights into hybrid immunity on BNT162b2-induced diverse memory B cells in response to Omicron breakthrough infection for generating diverse bNAbs with distinct structural basis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,392
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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