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Enregistrement W4308706066 · doi:10.1101/2022.11.07.515485

Discovery of benzo[c]phenanthridine derivatives with potent activity against multidrug resistant <i>Mycobacterium tuberculosis</i>

2022· preprint· en· W4308706066 sur OpenAlexafffund
Zhiqi Sun, Yi Chu Liang, Lu Chen, Andréanne Lupien, Zhongliang Xu, Stefania Berton, Marcel A. Behr, Weibo Yang, Jim Sun

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health CentreInstitute of Infection and ImmunityUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesJoint Research CentreCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Ottawa
Mots-clésMycobacterium tuberculosisTuberculosisRifampicinMicrobiologyPhenanthridineMultiple drug resistanceAntibioticsDrug resistanceMycobacteriumBacteriaDrug discoveryDrugPathogenChemistryBiologyMedicinePharmacologyBioinformaticsStereochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Mycobacterium tuberculosis (Mtb), the pathogen responsible for tuberculosis (TB), is the leading cause of bacterial disease-related death worldwide. Current antibiotic regimens for the treatment of TB remain dated and suffer from long treatment times as well as the development of drug-resistance. As such, the search for novel chemical modalities that have selective or potent anti-Mtb properties remains an urgent priority, particularly against multidrug resistant (MDR) Mtb strains. Herein, we design and synthesize 35 novel b enzo[c] p henanthridine d erivatives (BPD). The two most potent compounds, BPD-6 and BPD-9, accumulated within the bacterial cell and exhibited strong inhibitory activity (MIC 90 ∼ 2-10 μM) against multiple Mycobacterium strains, while remaining inactive against a range of other Gram-negative and Gram-positive bacteria. BPD-6 and BPD-9 were also effective in reducing Mtb viability within infected macrophages. The two BPD compounds displayed comparable efficacy to rifampicin, a critical frontline antibiotic used for the prevention and treatment of TB. Importantly, BPD-6 and BPD-9 inhibited the growth of multiple MDR Mtb clinical isolates, suggesting a completely novel mechanism of action compared to existing frontline TB dugs. The discovery of BPDs provides novel chemical scaffolds for anti-TB drug discovery. TOC/GRAPHICAL ABSTRACT

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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