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Enregistrement W4308707037 · doi:10.1101/2022.11.08.22281508

<i>NPC1</i> variants are not associated with Parkinson’s Disease, REM-sleep behaviour disorder or Dementia with Lewy bodies in European cohorts

2022· preprint· en· W4308707037 sur OpenAlexafffund
Emma N. Somerville, Lynne Krohn, Eric Yu, Uladzislau Rudakou, Konstantin Senkevich, Jennifer A. Ruskey, Farnaz Asayesh, Jamil Ahmad, Dan Spiegelman, Yves Dauvilliers, Isabelle Arnulf, Jacques Montplaisir, Jean‐François Gagnon, Alex Désautels, Abubaker Ibrahim, Ambra Stefani, Birgit Högl, Gian Luigi Gigli, Mariarosaria Valente, Francesco Janes, Andrea Bernardini, Petr Dušek, Karel Šonka, David Kemlink, Giuseppe Plazzi, Elena Antelmi, Francesco Biscarini, Brit Mollenhauer, Claudia Trenkwalder, Friederike Sixel‐Döring, Michela Figorilli, Monica Puligheddu, Valérie Cochen De Cock, Luigi Ferini‐Strambi, Anna Heibreder, Christelle Monaca, Beatriz Abril, Femke Dijkstra, Mineke Viaene, Bradley F. Boeve, Ronald B. Postuma, Guy A. Rouleau, Ziv Gan‐Or

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensUniversité de MontréalCanadian Sleep & Circadian NetworkMcGill Genome CentreHôpital du Sacré-Cœur de MontréalMcGill UniversityUniversité du Québec à MontréalMontfort HospitalMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesCanada First Research Excellence FundConsortium canadien en neurodégénérescence associée au vieillissementCanadian Institutes of Health ResearchParkinson CanadaMcGill UniversityMichael J. Fox Foundation for Parkinson's Research
Mots-clésSynucleinopathiesDementia with Lewy bodiesDementiaParkinson's diseaseNPC1Alpha-synucleinREM sleep behavior disorderLewy bodyDiseasePsychologyMedicineBiologyPathologyGeneticsReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract NPC1 encodes a lysosomal protein involved in cholesterol transport. Biallelic mutations in this gene may lead to Nieman-Pick disease type C, a lysosomal storage disorder. The role of NPC1 in alpha synucleinopathies is still unclear, as different genetic, clinical, and pathological studies have reported contradictory results. This study aimed to evaluate the association of NPC1 variants with the synucleinopathies Parkinson’s disease (PD), dementia with Lewy bodies (DLB), and rapid eye movement (REM)-sleep behavior disorder (RBD). We analyzed common and rare variants from three cohorts of European descent: 1,084 RBD cases and 2,945 controls, 2,852 PD cases and 1,686 controls, and 2,610 DLB cases and 1,920 controls. Logistic regression models were used to assess common variants while optimal sequence Kernel association tests (SKAT-O) were used to assess rare variants, both adjusted for sex, age, and principal components. No variants were associated with any of the synucleinopathies, supporting that common and rare NPC1 variants do not play an important role in alpha synucleinopathies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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