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Enregistrement W4308752107 · doi:10.1002/ggn2.202200014

A CRISPR Path to Finding Vulnerabilities and Solving Drug Resistance: Targeting the Diverse Cancer Landscape and Its Ecosystem

2022· review· en· W4308752107 sur OpenAlexaff
Benjamin J. McLean, Aji Istadi, Teleri Clack, Mezzalina Vankan, Daniel Schramek, G. Gregory Neely, Marina Pajic

Notice bibliographique

RevueAdvanced Genetics · 2022
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesSnow MedicalCancer Institute NSW
Mots-clésCRISPRDrug resistanceIdentification (biology)Tumor microenvironmentComputational biologyBiologyCancerDrug discoveryDiseaseGenomicsCancer researchBioinformaticsMedicineGeneticsGeneGenomePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cancer is the second leading cause of death globally, with therapeutic resistance being a major cause of treatment failure in the clinic. The dynamic signaling that occurs between tumor cells and the diverse cells of the surrounding tumor microenvironment actively promotes disease progression and therapeutic resistance. Improving the understanding of how tumors evolve following therapy and the molecular mechanisms underpinning de novo or acquired resistance is thus critical for the identification of new targets and for the subsequent development of more effective combination regimens. Simultaneously targeting multiple hallmark capabilities of cancer to circumvent adaptive or evasive resistance may lead to significantly improved treatment response in the clinic. Here, the latest applications of functional genomics tools, such as clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) editing, to characterize the dynamic cancer resistance mechanisms, from improving the understanding of resistance to classical chemotherapeutics, to deciphering unique mechanisms that regulate tumor responses to new targeted agents and immunotherapies, are discussed. Potential avenues of future research in combating therapeutic resistance, the contribution of tumor-stroma signaling in this setting, and how advanced functional genomics tools can help streamline the identification of key molecular determinants of drug response are explored.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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