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Enregistrement W4308843689 · doi:10.21203/rs.3.rs-2256298/v1

FINCA syndrome beyond pulmonary affection: biallelic NHLRC2 variants in eight families with intellectual disability and epilepsy

2022· preprint· en· W4308843689 sur OpenAlexafffund
Felix Boschann, Henrike L. Sczakiel, Max Zhao, Magdalena Danyel, Corinna Stoltenburg, Nadirah Damseh, Motee Ashhab, Tuğçe B. Balcı, Kalene van Engelen, Matt Osmond, Jens Schallner, Joseph Porrmann, Kimberly S. McDonald, Mingjuan Liao, Henry Oppermann, Konrad Platzer, Nadine Dierksen, Majid Mojarad, Atieh Eslahi, Behnaz Bakaeean, Reza Maroofian, Nadja Ehmke, Dominik Seelow, Denise Horn

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePeptidase Inhibition and Analysis
Établissements canadiensLondon Health Sciences Centre
Organismes subventionnairesBerlin Institute of HealthGenome British ColumbiaGenome AlbertaCanadian Institutes of Health ResearchGenome CanadaOntario GenomicsOntario Genomics Institute
Mots-clésIntellectual disabilityEpilepsyHypotoniaPhenotypeDystoniaMicrocephalyMedicineMissense mutationPulmonary fibrosisExome sequencingPathologyGeneticsPediatricsBiologyFibrosisPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract FINCA syndrome is an autosomal recessive inherited multisystemic disorder characterized by pulmonary fibrosis, neurodegeneration and cerebral angiomatosis. So far, 13 patients from nine families with biallelic NHLRC2 variants have been published. In all of them, the recurrent missense variant p.(Asp148Tyr) was detected at least on one allele. Common manifestations comprised pulmonary fibrosis, respiratory distress, developmental delay, muscular hypotonia, dystonia, seizures and brain atrophy, followed mostly by early demise due to progression of disease. Here, we present ten individuals from eight families with an overlapping but static phenotype with much longer survival, associated with seven novel NHLRC2 variants identified by exome analysis. All of the here described patients presented with severe global developmental delay. While seizures and EEG abnormalities were observed as frequent manifestations, eight individuals did not show any signs of pulmonary involvement or distinct MRI abnormalities. Notably, we also present the first seven cases in which the recurrent p.(Asp148Tyr) variant was not detected, neither in homozygous nor in compound heterozygous state. Interestingly, none of these cases presented with the classic FINCA phenotype. However, bioinformatic modeling and analyses could not establish a distinct genotype phenotype correlation. Taken together, our findings broaden the known phenotypic and molecular spectrum and propose that NHLRC2 related disease should also be considered in patients presenting with intellectual disability, movement disorders, neuroregression and epilepsy without pulmonary findings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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