Tissue culture coupled with a gas exchange system offers new perspectives on phenotyping the developmental biology of Solanum lycopersicum L. cv. ‘MicroTom’
Notice bibliographique
Résumé
Solanum lycopersicum L. cv. ‘Microtom’ (MicroTom) is a model organism with a relatively rapid life cycle, and wide library of genetic mutants available to study different aspects of plant development. Despite its small stature, conventional MicroTom research often requires expensive growth cabinets and/or expansive greenhouse space, limiting the number of experimental and control replications needed for experiments, and can render plants susceptible to pests and disease. Thus, alternative experimental approaches must be devised to reduce the footprint of experimental units and limit the occurrence problematic confounding variables. Here, tissue culture is presented as a powerful option for MicroTom research that can quell the complications associated with conventional MicroTom research methods. A previously established, non-invasive, analytical tissue culture system is used to compare in vitro and conventionally produced MicroTom by assessing photosynthesis, respiration, diurnal carbon gain, and fruit pigments. To our knowledge, this is the first publication that measures in vitro MicroTom fruit pigments and compares diurnal photosynthetic/respiration responses to abiotic factors between in vitro and ex vitro MicroTom. Comparable trends would validate tissue culture as a new benchmark method in MicroTom research, as it is like Arabidopsis, allowing replicable, statistically valid, high throughput genotyping and selective phenotyping experiments. Combining the model plant MicroTom with advanced tissue culture methods makes it possible to study bonsai-style MicroTom responses to light, temperature, and atmospheric stimuli in the absence of confounding abiotic stress factors that would otherwise be unachievable using conventional methods.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».