MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4308874322 · doi:10.3389/fonc.2022.1054497

Towards clinical implementation of circulating tumor DNA in metastatic prostate cancer: Opportunities for integration and pitfalls to interpretation

2022· review· en· W4308874322 sur OpenAlexafffund
Edmond M. Kwan, Alexander W. Wyatt, Kim N.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Oncology · 2022
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesKillam TrustsProstate Cancer Foundation
Mots-clésProstate cancerMedicineOncologyCancerGermlineBiomarkerPrecision medicineInternal medicineCancer researchBiologyPathologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plasma circulating tumor DNA (ctDNA) represents short fragments of tumor-derived DNA released into the bloodstream primarily from cancer cells undergoing apoptosis. In metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC), characterizing genomic alterations in ctDNA identifies mutations, copy number alterations, and structural rearrangements with predictive and prognostic biomarker utility. These associations with clinical outcomes have resulted in ctDNA increasingly incorporated into routine clinical care. In this review, we summarize current and emerging applications for ctDNA analysis in metastatic prostate cancer, including outcome prediction, treatment selection, and characterization of treatment resistance. We also discuss potential pitfalls with interpreting ctDNA findings, namely false negatives arising from low tumor content and optimal assay design, including correction for clonal hematopoiesis of indeterminate potential and germline variants. Understanding the influence of these limitations on interpretation of ctDNA results is necessary to overcome barriers to clinical implementation. Nevertheless, as assay availability and technology continue to improve, recognizing both opportunities and shortcomings of ctDNA analysis will retain relevance with informing the implementation of precision-oncology initiatives for metastatic prostate cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,028

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,098
Tête enseignante GPT0,437
Écart entre enseignants0,339 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in OncologyMême sujetCancer Genomics and DiagnosticsTravaux en français237 207