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Enregistrement W4308918775 · doi:10.1017/s095026882200139x

Characterisation of burden of illness measures associated with human (Fluoro)quinolone-resistant <i>Campylobacter</i> spp. infections – a scoping review

2022· review· en· W4308918775 sur OpenAlexafffundabout
M. J. Isada, Mark Reist, Melissa C. MacKinnon, F. Carl Uhland, Kaitlin M. Young, Kimberly Gibbens, E. Jane Parmley, Carolee A. Carson

Notice bibliographique

RevueEpidemiology and Infection · 2022
Typereview
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensUniversity of GuelphUniversity Health NetworkToronto Western HospitalHealth CanadaPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesPublic Health AgencyPublic Health Agency of Canada
Mots-clésCampylobacterCampylobacteriosisMedicineEnvironmental healthBiologyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Campylobacter spp. are one of the most common causes of bacterial gastroenteritis in Canada and worldwide. Fluoroquinolones are often used to treat complicated human campylobacteriosis and strains of Campylobacter spp. resistant to these drugs are emerging along the food chain. A scoping review was conducted to summarise how human (fluoro)quinolone-resistant (FQR; quinolones including fluoroquinolones) Campylobacter spp. infections are characterised in the literature by describing how burden of illness (BOI) associated with FQR is measured and reported, describing the variability in reporting of study characteristics, and providing a narrative review of literature that compare BOI measures of FQR Campylobacter spp. infections to those with susceptible infections. The review identified 26 studies that yielded many case reports, a lack of recent literature and a lack of Canadian data. Studies reported 26 different BOI measures and the most common were hospitalisation, diarrhoea, fever and duration of illness. There were mixed results as BOI measures reported in literature were inconsistently defined and there were limited comparisons between resistant and susceptible infections. This presents a challenge when attempting to assess the magnitude of the BOI due to FQR Campylobacter spp., highlighting the need for more research in this area.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,016
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,016
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,003
Bibliométrie0,0110,011
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,111
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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