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Enregistrement W4308954627 · doi:10.3390/genes13112020

Gene Expression Profile in the Sandhoff Mouse Brain with Progression of Age

2022· article· en· W4308954627 sur OpenAlexaff
Kshitiz Singh, Brianna M. Quinville, Melissa Mitchell, Zhilin Chen, Jagdeep S. Walia

Notice bibliographique

RevueGenes · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSandhoff diseasePathogenesisBiologyGangliosidosisGene expressionInflammationImmune systemNeurodegenerationImmunologyGeneNeuroscienceDiseasePathologyMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sandhoff disease (SD) is a fatal neurodegenerative disorder belonging to the family of diseases called GM2 Gangliosidosis. There is no curative treatment of SD. The molecular pathogenesis of SD is still unclear though it is clear that the pathology initiates with the build-up of ganglioside followed by microglial activation, inflammation, demyelination and apoptosis, leading to massive neuronal loss. In this article, we explored the expression profile of selected immune and myelination associated transcripts (Wfdc17, Ccl3, Lyz2, Fa2h, Mog and Ugt8a) at 5-, 10- and 16-weeks, representing young, pre-symptomatic and late stages of the SD mice. We found that immune system related genes (Wfdc17, Ccl3, Lyz2) are significantly upregulated by several fold at all ages in Hexb-KO mice relative to Hexb-het mice, while the difference in the expression levels of myelination related genes is not statistically significant. There is an age-dependent significant increase in expression of microglial/pro-inflammatory genes, from 5-weeks to the near humane end-point, i.e., 16-week time point; while the expression of those genes involved in myelination decreases slightly or remains unchanged. Future studies warrant use of new high-throughput gene expression modalities (such as 10X genomics) to delineate the underlying pathogenesis in SD by detecting gene expression changes in specific neuronal cell types and thus, paving the way for rational and precise therapeutic modalities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,378

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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