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Enregistrement W4308989369 · doi:10.1016/j.jmoldx.2022.10.003

Evaluating Multiple Next-Generation Sequencing–Derived Tumor Features to Accurately Predict DNA Mismatch Repair Status

2022· article· en· W4308989369 sur OpenAlexafffund
Romy Walker, Peter Georgeson, Khalid Mahmood, Jihoon E. Joo, Enes Makalic, Mark Clendenning, Julia Como, Susan Preston, Sharelle Joseland, Bernard J. Pope, Ryan Hutchinson, Kais Kasem, Michael D. Walsh, Finlay Macrae, Aung Ko Win, John L. Hopper, Dmitri Mouradov, Peter Gibbs, Oliver M. Sieber, Dylan E. O’Sullivan, Darren R. Brenner, Steven Gallinger, Mark A. Jenkins, Christophe Rosty, Ingrid Winship, Daniel D. Buchanan

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Diagnostics · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer ResearchAlberta Health ServicesUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchNational Health and Medical Research CouncilWalter and Eliza Hall Institute of Medical ResearchState Government of VictoriaUniversity of MelbourneAustralian Genome Research Facility
Mots-clésDNA sequencingDNA mismatch repairComputational biologyComputer scienceDNABiologyGeneticsDNA repair

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,119
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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