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Enregistrement W4308990726 · doi:10.1145/3567711

Tangible Chromatin: Tangible and Multi-surface Interactions for Exploring Datasets from High-Content Microscopy Experiments

2022· article· en· W4308990726 sur OpenAlexaff
Roozbeh Manshaei, Uzair Mayat, Syeda Aniqa Imtiaz, Veronica Andric, Kazeera Aliar, Nour Abu Hantash, Kashaf Masood, Gabby Resch, Alexander Bakogeorge, Sarah Sabatinos, Ali Mazalek

Notice bibliographique

RevueProceedings of the ACM on Human-Computer Interaction · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueData Visualization and Analytics
Établissements canadiensToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer scienceReplication (statistics)Human–computer interactionInterpretation (philosophy)Complement (music)VisualizationData scienceData miningChemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In biology, microscopy data from thousands of individual cellular events presents challenges for analysis and problem solving. These include a lack of visual analysis tools to complement algorithmic approaches for tracking important but rare cellular events, and a lack of support for collaborative exploration and interpretation. In response to these challenges, we have designed and implemented Tangible Chromatin, a tangible and multi-surface system that promotes novel analysis of complex data generated from high-content microscopy experiments. The system facilitates three specific approaches to analysis: it (1) visualizes the detailed information and results from the image processing algorithms, (2) provides interactive approaches for browsing, selecting, and comparing individual data elements, and (3) expands options for productive collaboration through both independent and joint work. We present three main contributions: (i) design requirements that derive from the analytical goals of DNA replication biology, (ii) tangible and multi-surface interaction techniques to support the exploration and analysis of datasets from high-content microscopy experiments, and (iii) the results of a user study that investigated how the system supports individual and collaborative data analysis and interpretation tasks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,239
Score d'incertitude au seuil0,714

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,226
Tête enseignante GPT0,388
Écart entre enseignants0,161 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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