IMMU-09. IMMUNOLOGICAL CHARACTERIZATION OF PEDIATRIC BRAIN TUMORS HAS CLINICAL IMPLICATIONS FOR PATIENT MANAGEMENT AND PROGNOSIS
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The tumor immune microenvironment (TIME) is a growing area of interest, however, the extent of immune activation in childhood CNS tumors is unknown. Although immunotherapy has not gained success in most CNS cancers, our group described gliomas with MMRD which exhibit hypermutation and favorable responses to immune checkpoint inhibition (ICI). Therefore, detailed characterization of the CNS TIME is key for the development of novel immunotherapeutic strategies and application of existing ones in childhood brain tumors. We developed a clinical NanoString immune-oncology panel that includes markers reflecting cell types, therapeutic targets, and cellular pathways, as well as the 18-gene tumor inflammation signature (TIS), a biomarker for ICI response. We tested over 500 brain tumors, including 266 low-grade gliomas (LGG), 170 high-grade gliomas (HGG), 91 MMRD tumors, 16 ependymomas, 46 medulloblastomas, and 36 non-tumor brain samples. Overall, ependymomas and medulloblastomas had low levels of inflammation, although SHH medulloblastomas had higher inflammation than other subtypes. IDH-mutant LGG were immunologically cold, while many gliomas with pediatric-LGG mutations had high levels of inflammation, including upregulation of immune checkpoints – indicating that ICI may be an effective strategy. Interestingly, in pediatric-LGG inflammation impacted outcome in tumors with the same genetic alterations. BRAF V600E-mutant LGG exhibiting high TIS had inferior prognosis (p = 0.02), while no such relationship was observed in BRAF-fused tumors. Diffuse midline gliomas had higher inflammation than hemispheric HGG, indicating that these tumors are not immunologically cold, as has been previously reported. In MMRD tumors treated with ICI, high TIS correlated with improved survival and was independent from hypermutation and mutational burden. Furthermore, MMRD gliomas had high expression of several other immune checkpoints including LAG3, suggesting its value as an additional therapeutic target. In summary, characterization of the TIME across pediatric brain tumors provides potential prognostic clues and suggest treatment strategies for further investigation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».