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Enregistrement W4309017078 · doi:10.1093/neuonc/noac209.113

CNSC-32. ACTIN SUBUNIT STRUCTURAL DIVERSITY IN SHH MEDULLOBLASTOMA: IMPLICATIONS FOR CANCER BIOLOGY AND NEURODEVELOPMENT

2022· article· en· W4309017078 sur OpenAlexaff
Jamie Beaulieu, David J. H. F. Knapp, Daniel Picard, Marc Remke, Abbas F. Sadikot, Roberto J. Diaz

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and HospitalUniversité de MontréalInstitute for Research in Immunology and CancerMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyActinCell biologySonic hedgehogMolecular biologySignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract BACKGROUND Altered expression of actin subunits is found in multiple cancers. Alpha-cardiac actin (ACTC1) is expressed in sonic hedgehog medulloblastoma (SHH MB) and regulates both cell survival and migration. We hypothesized that cardiac actin has a unique structural and functional role in SHH MB and may be expressed in post-natal granule cell progenitors (GCPs) which share similar gene expression profiles. METHODS Actin subunit protein expression (ACTC1, ACTB, ACTG1, and ACTA2) was evaluated by mRNA expression profiling within established datasets and across MB cell lines by Western blot (WB). Immunofluorescence microscopy was performed to assess intracellular actin subunit localization. The composition of each subunit in filamentous (F-) actin was evaluated. Furthermore immunoprecipitation of filamentous ACTC1 was performed to assess protein-protein interactions. The ratio of F-actin to globular (G-) actin was determined by WB in SHH MB cells exposed to mitotic inhibitor. Cell viability was determined by colony formation following over-expression of dominant-negative mutant ACTC1 (P116C & G247D). RESULTS ACTC1, ACTG1, and ACTB are the predominant actin subunits in SHH MB. Immunofluorescence microscopy demonstrated co-localization of ACTC1 with ACTG1 and ACTB but not ACTA2. ACTC1 showed a unique cortical localization pattern. Post-natal MATH1 positive mouse GCPs (P3-5) demonstrate similar distribution of ACTC1 in cortical F-actin. WB analysis of ACTC1 pulldown from SHH MB cell F-actin fractions showed co-precipitation with ACTG1 and ACTB but not ACTA2. ACTC1 F-actin to G-actin ratio is maintained in cells that show resistance to mitotic inhibition. Expression of mutant ACTC1 G247D resulted in reduced cell survival. CONCLUSIONS ACTC1 subunit is incorporated into F-actin in SHH MB and GCPs. Filamentous ACTC1 forms a protein complex with ACTG1 and ACTB. Disruption of ACTC1 polymerization results in reduced cell survival. These findings suggest a functional role of ACTC1 in both SHH MB and in GCPs which are important in cerebellar development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,344
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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