MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4309087930 · doi:10.1186/s13068-022-02223-w

Functional analysis of the dehydratase domains of the PUFA synthase from Emiliania huxleyi in Escherichia coli and Arabidopsis thaliana

2022· article· en· W4309087930 sur OpenAlexfundno aff
Bihan Chen, Feng Wang, Xi Xie, Huifan Liu, Dongjie� Liu, Lukai Ma, Gengsheng Xiao, Qin Wang

Notice bibliographique

RevueBiotechnology for Biofuels and Bioproducts · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBasic and Applied Basic Research Foundation of Guangdong ProvinceInstitute of GeneticsNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiochemistryDehydrataseArabidopsis thalianaEmiliania huxleyiBiologyEscherichia coliFatty acidPolyunsaturated fatty acidMutantEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Polyunsaturated fatty acid (PUFA) synthase is a multi-domain mega-enzyme that effectively synthesizes a series of PUFAs in marine microorganisms. The dehydratase (DH) domain of a PUFA synthase plays a crucial role in double bond positioning in fatty acids. Sequencing results of the coccolithophore Emiliania huxleyi ( E. huxleyi, Eh ) indicated that this species contains a PUFA synthase with multiple DH domains. Therefore, the current study, sought to define the functions of these DH domains ( Eh DHs), by cloning and overexpressing the genes encoding FabA-like Eh DHs in Escherichia coli ( E. coli ) and Arabidopsis thaliana ( A. thaliana ). Results A complementation test showed that the two FabA-like DH domains could restore DH function in a temperature-sensitive ( Ts ) mutant. Meanwhile, overexpression of FabA-like Eh DH 1 and Eh DH 2 domains increased the production of unsaturated fatty acids (UFAs) in recombinant E. coli by 43.5–32.9%, respectively. Site-directed mutagenesis analysis confirmed the authenticity of active-site residues in these domains. Moreover, the expression of tandem Eh DH 1 -DH 2 in A. thaliana altered the fatty acids content, seed weight, and germination rate. Conclusions The two FabA-like DH domains in the E. huxleyi PUFA synthase function as 3-hydroxyacyl-acyl carrier protein dehydratase in E. coli . The expression of these domains in E. coli and A. thaliana can alter the fatty acid profile in E. coli and increase the seed lipid content and germination rate in A. thaliana . Hence, introduction of DH domains controlling the dehydration process of fatty acid biosynthesis in plants might offer a new strategy to increase oil production in oilseed plants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,075
Score d'incertitude au seuil0,421

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiotechnology for Biofuels and BioproductsMême sujetLipid metabolism and biosynthesisTravaux en français237 207