Clinical Evaluation of the GeneXpert <sup>®</sup> Xpert <sup>®</sup> Xpress SARS-CoV-2/Flu/RSV <i>PLUS</i> Combination Test
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The GeneXpert ® Xpert ® Xpress SARS-CoV-2/Flu/RSV PLUS combination test ( PLUS Assay) received Health Canada approval in January 2022. The PLUS Assay is similar to the SARS-CoV-2/Flu/RSV combination test, with modifications to improve assay robustness against circulating and emerging variants. The performance characteristics of the PLUS Assay were assessed at the Lakeridge Health Oshawa Hospital Centre and the National Microbiology Laboratory of Canada. The PLUS Assay was directly compared to the SARS-CoV-2/Flu/RSV combination test using SARS-CoV-2 culture from five variants and remnant clinical specimens collected across the COVID-19 pandemic. This included 50 clinical specimens negative for all pathogens, 110 clinical specimens positive for SARS-CoV-2, Influenza A, Influenza B, RSVA, and/or RSVB and an additional 11 mixed samples to screen for target interactions. The PLUS Assay showed a high percent agreement with the widely used SARS-CoV-2/Flu/RSV combination test. Based on these findings, the PLUS Assay and the Xpert SARS-CoV-2/Flu/RSV combination test results are largely consistent with no observed difference in sensitivity, specificity, or time to result when challenged with various SARS-CoV-2 variants. The reported Ct values provided by the new PLUS Assay was also unchanged, with the exception of a possible 1-2 decrease reported Ct for RSVA across a limited sample size.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,007 | 0,011 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».