Progenitor cell‐derived basophils: A novel barcoded passive degranulation assay in allergic diseases
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Effector cells assays provide an overall measure of responsiveness to allergen, but the lack of reliable and high‐throughput assays limits the clinical utility. We aimed to develop a high‐throughput basophil activation test based on human progenitor cell‐derived basophils (PCB) and investigate the role of PCB activation test (PCBAT) in allergic diseases. Methods Progenitor cell‐derived basophils were differentiated from CD34+ progenitor cells and sensitized with sera from subjects sensitized to cat, peanut or atopic controls. Sensitized PCBs were stimulated with increasing concentrations of the corresponding allergens in vitro. Degranulation was assessed by measuring CD63 expression using flow cytometry. The correlations between PCBAT and clinical allergy were assessed. Results Following passive sensitization of the mature PCBs with serum and allergen stimulation, an allergen specific dose‐dependent increase in CD63 expression was observed. Sera from subjects sensitized to cat (n = 35, of which 17 subjects had clinical reactivity quantified using inhaled allergen challenge), peanut allergic (n = 30, of which 15 subjects had clinical reactivity validated using double blind, placebo controlled food challenges [DBPCFC]), peanut‐sensitized but tolerant subjects (n = 5) were used to sensitize PCBs. PCBAT area under the curve (AUC) correlated with sIgE (r2 = .49, p = .001) in subjects sensitized to cat (sIgE ≥ 0.35KU/L). The provocation concentration of inhaled cat allergen (PC20) correlated with PCBAT AUC (r2 = .33, p = .016). In subjects sensitized to peanut, PCBAT AUC was highly correlated with sIgE to Ara h 2 (r2 = .59, p < .0001). Peanut threshold cumulative dose during DBPCFC was negatively correlated with PCBAT AUC (r2 = .57, p = .001) and IgE to Ara h1 (r2 = .55, p = .007), but not with sIgE to whole peanut or Ara h2. All peanut‐sensitized but tolerant subjects showed no reaction to peanut on PCBAT. Conclusion Progenitor cell‐derived basophils activation test is a high‐throughput assay, which correlates with clinical allergy and may confer a powerful alternative tool in allergy testing.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».