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Enregistrement W4309246513 · doi:10.1111/cea.14251

Progenitor cell‐derived basophils: A novel barcoded passive degranulation assay in allergic diseases

2022· article· en· W4309246513 sur OpenAlexafffund
Jiakai Wu, Rajia Bahri, Marina Tsoumani, Aida Semic‐Jusufagic, Clare Murray, Adnan Čustović, George V. Guibas, Miriam Bennett, Ran Wang, Gail M. Gauvreau, Ruth P. Cusack, E. N. Clare Mills, Silvia Bulfone‐Paus, Angela Simpson

Notice bibliographique

RevueClinical & Experimental Allergy · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFood Allergy and Anaphylaxis Research
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesManchester Biomedical Research CentreMedical Research Council CanadaMedical Research CouncilNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésCD63ImmunologyAllergenBasophil activationDegranulationBasophilProgenitor cellMedicineAllergySensitizationImmunoglobulin EFlow cytometryArea under the curveProvocation testAntibodyStem cellPharmacologyInternal medicineChemistryBiologyReceptorPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Effector cells assays provide an overall measure of responsiveness to allergen, but the lack of reliable and high‐throughput assays limits the clinical utility. We aimed to develop a high‐throughput basophil activation test based on human progenitor cell‐derived basophils (PCB) and investigate the role of PCB activation test (PCBAT) in allergic diseases. Methods Progenitor cell‐derived basophils were differentiated from CD34 + progenitor cells and sensitized with sera from subjects sensitized to cat, peanut or atopic controls. Sensitized PCBs were stimulated with increasing concentrations of the corresponding allergens in vitro. Degranulation was assessed by measuring CD63 expression using flow cytometry. The correlations between PCBAT and clinical allergy were assessed. Results Following passive sensitization of the mature PCBs with serum and allergen stimulation, an allergen specific dose‐dependent increase in CD63 expression was observed. Sera from subjects sensitized to cat ( n = 35, of which 17 subjects had clinical reactivity quantified using inhaled allergen challenge), peanut allergic ( n = 30, of which 15 subjects had clinical reactivity validated using double blind, placebo controlled food challenges [DBPCFC]), peanut‐sensitized but tolerant subjects ( n = 5) were used to sensitize PCBs. PCBAT area under the curve (AUC) correlated with sIgE ( r 2 = .49, p = .001) in subjects sensitized to cat (sIgE ≥ 0.35KU/L). The provocation concentration of inhaled cat allergen (PC 20 ) correlated with PCBAT AUC ( r 2 = .33, p = .016). In subjects sensitized to peanut, PCBAT AUC was highly correlated with sIgE to Ara h 2 ( r 2 = .59, p < .0001). Peanut threshold cumulative dose during DBPCFC was negatively correlated with PCBAT AUC ( r 2 = .57, p = .001) and IgE to Ara h1 ( r 2 = .55, p = .007), but not with sIgE to whole peanut or Ara h2. All peanut‐sensitized but tolerant subjects showed no reaction to peanut on PCBAT. Conclusion Progenitor cell‐derived basophils activation test is a high‐throughput assay, which correlates with clinical allergy and may confer a powerful alternative tool in allergy testing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,685
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,369
Écart entre enseignants0,315 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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