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Enregistrement W4309261996 · doi:10.21203/rs.3.rs-2273912/v1

Increased D-Neopterin biosynthesis in gut microbiome promoted colonic carcinogenesis after ampicillin or amoxicillin treatment

2022· preprint· en· W4309261996 sur OpenAlexfundno aff
yuhang zhang, Yuan Dong, Wenyu Wang, Hang Zhou, Cui Yi-min

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesPeking UniversityPeking University First HospitalNational Natural Science Foundation of ChinaMcGill University
Mots-clésAmpicillinAmoxicillinGut floraMicrobiomeColorectal cancerCarcinogenesisBiologyNeopterinAntibioticsCancer researchFecesMicrobiologyImmunologyCancerBioinformaticsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background:Emerging data have manifested that antibiotic-induced perturbations can potentially increase susceptibility to colorectal cancer (CRC), while the underlying mechanism is still unclear.Results:Herein we established the humanized microbiome mice transplanted with feces and hematopoietic stem cells from CRC patients to explore how ampicillin or amoxicillin contributed to colorectal cancer progression. Metagenomics and untargeted metabolomics analyses have suggested the effect of ampicillin or amoxicillin on colonic tumorigenesis is correlated with an alteration of gut microbiota and increased levels of the microbiota-derived metabolite D-Neopterin (P< 0.05). Then D-Neopterin is evidenced to activate the expressions of IGF2BP1 and ARG1 in myeloid-derived suppressor cells (MDSCs) by scRNA-seq. Moreover, IGF2BP1 was determined to maintain the stability of ARG1 transcript by binding to three m6A sites of ARG1‐3’UTR in the sorted MDSCs.Conclusion:In essence, this study has identified the important role of ampicillin or amoxicillin-induced increase of D-Neopterin in enhancing colorectal cancer proliferation. It thus implicates that therapeutic regimen of CRC patients should eliminate the application of ampicillin or amoxicillin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,376
Écart entre enseignants0,314 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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