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Enregistrement W4309300466 · doi:10.1101/2022.11.17.516185

The central role of pyruvate metabolism on the epigenetic and molecular maturation of bovine cumulus-oocytes complexes

2022· preprint· en· W4309300466 sur OpenAlexaff
João Vitor Alcantara da Silva, Jessica Ispada, Aldcejam Martins da Fonseca, Camila Bruna de Lima, Érika Cristina dos Santos, Marcos Roberto Chiaratti, Ricardo Perecin Nociti, Marcella Pecora Milazzotto

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueReproductive Biology and Fertility
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCitric acid cycleGlycolysisOocyteChemistrySodium pyruvateAcetylationMetabolismAcetyl-CoABiochemistryMitochondrionCell biologyBiologyEmbryoGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Pyruvate, the end-product of glycolysis in aerobic conditions, is produced by cumulus cells, and is converted in Acetyl-CoA into the mitochondria of both cumulus cells (CCs) and oocytes as a master fuel input for the tricarboxylic acid cycle (TCA). The citrate generated in the TCA cycle can be directed to the cytoplasm and converted back to acetyl-CoA, being driven to lipid synthesis or, still, being used as the substrate for histones acetylation. This work aimed to verify the impact of pyruvate metabolism on the dynamic of lysine 9 histone 3 acetylation (H3K9ac) and RNA transcription in bovine cumulus-oocyte complexes during in vitro maturation (IVM). Bovine oocytes were IVM for 24h in three experimental groups: Control [IVM medium], sodium dichloroacetate [DCA, a stimulator of pyruvate oxidation in acetyl-CoA] or sodium iodoacetate [IA, a glycolysis inhibitor]. Our results show that both treatments change the metabolic profile of oocytes and CCs, stimulating the use of lipids for energy metabolism in the gamete. This leads to changes in the dynamics of H3K9ac during the IVM in both oocytes and CCs with impact on the synthesis of new transcripts in CCs. A total of 148 and 356 differentially expressed genes were identified in DCA and IA oocytes groups, respectively, when compared to the control group. In conclusion, disorders in pyruvate metabolism during maturation stimulate the beta-oxidation pathway, altering the mitochondrial metabolism, with consequences for the mRNA content of bovine oocytes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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