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Enregistrement W4309426608 · doi:10.1101/2022.11.18.517169

Comprehension of Antimicrobial Peptides Modulation of the Type VI Secretion System in <i>Vibrio cholerae</i>

2022· preprint· en· W4309426608 sur OpenAlexaff
Annabelle Mathieu‐Denoncourt, Marylise Duperthuy

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesUmeå Universitet
Mots-clésType VI secretion systemVibrio choleraeMicrobiologyVirulenceSecretionBiologyBacteriaPolymyxin BProteomeVibrioChemistryGeneticsGeneBiochemistryAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The Type VI secretion System (T6SS) is a versatile weapon used by bacteria for virulence, resistance to grazing and competition with other bacteria. We previously demonstrated that the role of the T6SS in interbacterial competition and in resistance to grazing is enhanced in Vibrio cholerae in the presence of subinhibitory concentrations of polymyxin B (PmB). In this study, we performed a global quantitative proteomic analysis by liquid chromatography coupled to mass spectrometry and a transcriptomic analysis by quantitative PCR of the T6SS known regulators in V. cholerae grown with and without PmB. The proteome of V. cholerae is greatly modified in the presence of PmB at subinhibitory concentrations with more than 39 % of the identified cellular proteins displaying a difference in their abundance, including T6SS-related proteins (Hcp, VasC, TsaB and ClpV). We identified a regulator whose abundance and expression are increased in the presence of PmB, vxrB , the response regulator of the two-component system VxrAB. In a vxrAB deficient mutant, the expression of hcp measured by quantitative PCR, although globally reduced, was not modified in the presence of PmB, confirming its role in hcp upregulation with PmB. The upregulation of the T6SS in the presence of PmB appears to be, at least in part, due to the two-component system VxrAB. Importance The type VI secretion system is important for bacterial competition, virulence and resistance to grazing by predators. In this study, we investigated the regulation leading to the type VI secretion system activation in the presence of polymyxin B (PmB), an antimicrobial used in veterinary and human health to treat infection caused by multi-resistant Gram-negative bacteria, in V. cholerae . In addition to making an overall portrait of the modifications to the proteome, we identified the VxrAB two-component system as the main regulator responsible for this activation. Our results provide evidence that subinhibitory concentrations of antimicrobials are responsible for important modifications of the proteome of pathogenic bacteria, inducing the production of proteins involved in virulence, host colonisation, resistance and environmental survival.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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