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Enregistrement W4309525110 · doi:10.1371/journal.pone.0269649

A natural history study to track brain and spinal cord changes in individuals with Friedreich’s ataxia: TRACK-FA study protocol

2022· article· en· W4309525110 sur OpenAlexafffund
Nellie Georgiou‐Karistianis, Louise A. Corben, Kathrin Reetz, Isaac Adanyeguh, Manuela Corti, Dinesh K. Deelchand, Martin B. Delatycki, Imis Dogan, Rebecca Evans, Jennifer Farmer, Marcondes C. França, William Gaetz, Ian H. Harding, Karen S. Harris, Steven M. Hersch, Richard Joules, James M. Joers, Michelle L. Krishnan, Michelle Lax, Eric F. Lock, David T. Lynch, Thomas H. Mareci, Sahan Muthuhetti Gamage, Massimo Pandolfo, Marina Papoutsi, Thiago Junqueira Ribeiro de Rezende, Timothy P. L. Roberts, Jens T. Rosenberg, Sandro Romanzetti, Jörg B. Schulz, Traci Schilling, Adam J. Schwarz, S. H. Subramony, Bert Yao, Stephen Zicha, Christophe Lenglet, Pierre‐Gilles Henry

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesMonash UniversityAtaxia UKMcGill UniversityRWTH Aachen UniversityUniversity of MinnesotaPTC TherapeuticsNovartis Pharmaceuticals CorporationChildren's Hospital of PhiladelphiaIXICOFriedreich's Ataxia Research AllianceMuscular Dystrophy AssociationTakeda Pharmaceutical CompanyNational Institutes of HealthNational Ataxia FoundationBiogen
Mots-clésNeuroimagingMedicineAtaxiaCohortNatural history studyFrataxinCohort studyMagnetic resonance imagingPhysical medicine and rehabilitationPathologyDiseaseInternal medicinePsychiatryRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Drug development for neurodegenerative diseases such as Friedreich's ataxia (FRDA) is limited by a lack of validated, sensitive biomarkers of pharmacodynamic response in affected tissue and disease progression. Studies employing neuroimaging measures to track FRDA have thus far been limited by their small sample sizes and limited follow up. TRACK-FA, a longitudinal, multi-site, and multi-modal neuroimaging natural history study, aims to address these shortcomings by enabling better understanding of underlying pathology and identifying sensitive, clinical trial ready, neuroimaging biomarkers for FRDA. METHODS: 200 individuals with FRDA and 104 control participants will be recruited across seven international study sites. Inclusion criteria for participants with genetically confirmed FRDA involves, age of disease onset ≤ 25 years, Friedreich's Ataxia Rating Scale (FARS) functional staging score of ≤ 5, and a total modified FARS (mFARS) score of ≤ 65 upon enrolment. The control cohort is matched to the FRDA cohort for age, sex, handedness, and years of education. Participants will be evaluated at three study visits over two years. Each visit comprises of a harmonized multimodal Magnetic Resonance Imaging (MRI) and Spectroscopy (MRS) scan of the brain and spinal cord; clinical, cognitive, mood and speech assessments and collection of a blood sample. Primary outcome measures, informed by previous neuroimaging studies, include measures of: spinal cord and brain morphometry, spinal cord and brain microstructure (measured using diffusion MRI), brain iron accumulation (using Quantitative Susceptibility Mapping) and spinal cord biochemistry (using MRS). Secondary and exploratory outcome measures include clinical, cognitive assessments and blood biomarkers. DISCUSSION: Prioritising immediate areas of need, TRACK-FA aims to deliver a set of sensitive, clinical trial-ready neuroimaging biomarkers to accelerate drug discovery efforts and better understand disease trajectory. Once validated, these potential pharmacodynamic biomarkers can be used to measure the efficacy of new therapeutics in forestalling disease progression. CLINICAL TRIAL REGISTRATION: ClinicalTrails.gov Identifier: NCT04349514.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,076

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0040,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0040,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0230,010

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,093
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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