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Enregistrement W4309572701 · doi:10.1177/08465371221139418

Is There Evidence of P-Hacking in Imaging Research?

2022· article· en· W4309572701 sur OpenAlexafffund
Paul Rooprai, Nayaar Islam, Jean‐Paul Salameh, Sanam Ebrahimzadeh, Abrar Kazi, Robert Frank, Tim Ramsay, Maya B. Mathur, Marissa Absi, Ahmed Al Khalil, Sakib Kazi, Haben Dawit, Eric W.‐F. Lam, Nicholas Fabiano, Matthew D. F. McInnes

Notice bibliographique

RevueCanadian Association of Radiologists Journal · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueMeta-analysis and systematic reviews
Établissements canadiensOttawa HospitalCarleton UniversityUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesU.S. National Library of MedicineUniversity of Ottawa
Mots-clésMedicineHackerMedical physicsComputer security

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background P-hacking, the tendency to run selective analyses until they become significant, is prevalent in many scientific disciplines. Purpose This study aims to assess if p-hacking exists in imaging research. Methods Protocol, data, and code available here https://osf.io/xz9ku/?view_only=a9f7c2d841684cb7a3616f567db273fa . We searched imaging journals Ovid MEDLINE from 1972 to 2021. Text mining using Python script was used to collect metadata: journal, publication year, title, abstract, and P-values from abstracts. One P-value was randomly sampled per abstract. We assessed for evidence of p-hacking using a p-curve, by evaluating for a concentration of P-values just below .05. We conducted a one-tailed binomial test (α = .05 level of significance) to assess whether there were more P-values falling in the upper range (e.g., .045 < P < .05) than in the lower range (e.g., .04 < P < .045). To assess variation in results introduced by our random sampling of a single P-value per abstract, we repeated the random sampling process 1000 times and pooled results across the samples. Analysis was done (divided into 10-year periods) to determine if p-hacking practices evolved over time. Results Our search of 136 journals identified 967,981 abstracts. Text mining identified 293,687 P-values, and a total of 4105 randomly sampled P-values were included in the p-hacking analysis. The number of journals and abstracts that were included in the analysis as a fraction and percentage of the total number was, respectively, 108/136 (80%) and 4105/967,981 (.4%). P-values did not concentrate just under .05; in fact, there were more P-values falling in the lower range (e.g., .04 < P < .045) than falling just below .05 (e.g., .045 < P < .05), indicating lack of evidence for p-hacking. Time trend analysis did not identify p-hacking in any of the five 10-year periods. Conclusion We did not identify evidence of p-hacking in abstracts published in over 100 imaging journals since 1972. These analyses cannot detect all forms of p-hacking, and other forms of bias may exist in imaging research such as publication bias and selective outcome reporting.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,344
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,803
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,997
Score d'incertitude au seuil0,809

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,3440,803
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,005
Bibliométrie0,0100,014
Études des sciences et des technologies0,0020,016
Communication savante0,0070,011
Science ouverte0,0050,006
Intégrité de la recherche0,0050,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0180,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,770
Tête enseignante GPT0,559
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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