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Enregistrement W4309600359 · doi:10.1523/eneuro.0265-22.2022

Cortical Pyramidal and Parvalbumin Cells Exhibit Distinct Spatiotemporal Extracellular Electric Potentials

2022· article· en· W4309600359 sur OpenAlexfundno aff
Lior J. Sukman, Eran Stark

Notice bibliographique

RevueeNeuro · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeural dynamics and brain function
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHORIZON EUROPE European Research CouncilAzrieli FoundationIsrael Science FoundationUnited States-Israel Binational Science FoundationRosetrees TrustInternational Development Research Centre
Mots-clésNeocortexExtracellularParvalbuminOptogeneticsNeuroscienceHippocampal formationDepolarizationElectrophysiologyWaveformSomaBiological systemBiologyPattern recognition (psychology)PhysicsBiophysicsComputer scienceArtificial intelligenceCell biologyVoltage

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Brain circuits are composed of diverse cell types with distinct morphologies, connections, and distributions of ion channels. Modeling suggests that the spatial distribution of the extracellular voltage during a spike depends on cellular morphology, connectivity, and identity. However, experimental evidence from the intact brain is lacking. Here, we combined high-density recordings from hippocampal region CA1 and neocortex of freely moving mice with optogenetic tagging of parvalbumin-immunoreactive (PV) cells. We used ground truth tagging of the recorded pyramidal cells (PYR) and PV cells to construct binary classification models. Features derived from single-channel waveforms or from spike timing alone allowed near-perfect classification of PYR and PV cells. To determine whether there is unique information in the spatial distribution of the extracellular potentials, we removed all single-channel waveform information from the multichannel waveforms using an event-based delta-transformation. We found that spatiotemporal features derived from the transformed waveforms yield accurate classification. The extracellular analog of the spatial distribution of the initial depolarization phase provided the highest contribution to the spatially based prediction. Compared with PV cell spikes, PYR spikes exhibited higher spatial synchrony at the beginning of the extracellular spike and lower synchrony at the trough. The successful classification of PYR and PV cells based on purely spatial features provides direct experimental evidence that spikes of distinct cell types are associated with distinct spatial distributions of extracellular potentials.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,109
Score d'incertitude au seuil0,634

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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