T cell-intrinsic protein kinase D3 is dispensable for the cells’ activation
Notice bibliographique
Résumé
Protein kinases D (PKDs) are implicated in T cell receptor (TCR) signaling. Of the two T cell-expressed isoforms PKD2 and PKD3, however, only the former one is rather well understood in this immune cell type. Recently, we have observed a putative hyper-phenotype of T cells from conventional PKD3-knockout mice, which we explained as a secondary effect due to a skewed T cell compartment from naïve towards effector/memory T cells already under steady state conditions. Nonetheless, to this end it is not clear whether these aberrations are mediated by a T cell-intrinsic or -extrinsic function of PKD3. To address this question, we have investigated mice lacking PKD3 specifically in the T cell compartment. We could show that T cells from CD4-Cre-driven conditional knockout mice did not phenocopy the ones from conventional PKD3-knockout mice. In brief, no skewing in the T cell compartment of peripheral lymphoid organs, no hyper-activation upon stimulation in vitro or in vivo as well as no aberrations in follicular helper T cells (TFH) upon immunization were observed. Hence, although PKD3 is strongly regulated upon TCR stimulation, in T cells this kinase seems to be dispensable for their activation. The described skewing in the T cell compartment of conventional PKD3-deficient mice seems to be mediated by T cell-extrinsic mechanisms, thus once more emphasizing the importance of cell type-specific mouse models.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».