Airways tissue expression of type I interferons and their stimulated genes is higher in children than adults
Notice bibliographique
Résumé
There is emerging evidence that age-dependent differences in susceptibility to severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) correlate with stronger innate immune response in the upper respiratory tract in children compared to adults. The efficient induction of interferon (IFN) alpha and beta (α and β) signaling, and interferon-stimulated genes (ISGs) is fundamental to the host antiviral response. In-silico transcriptomic analyses was conducted to determine the expression levels of IFN α/β pathway genes as well as 524 human ISGs in upper and lower airways of children and adults at baseline and post respiratory infections including coronavirus disease 2019 (COVID-19). To validate our in-silico analysis, we conducted qRT-PCR to measure ISGs levels in children and adult's nasal epithelial samples. At baseline, children had significantly higher levels of IFN α/β and ISGs genes compared to adults. More distinction was also seen in bronchial compared to nasal basal levels. Children nasal epithelial cells exhibited superior antiviral IFN α/β and associated ISGs response following ex-vivo poly (I:C) treatment model, and in clinical samples of SARS-CoV-2 infected patients. This was also confirmed in nasal epithelial samples using qRT-PCR validation. No gender-based difference in type I IFN levels across both age groups were observed. Understanding the biological basis for children resistance against severe COVID-19 is a challenge that has substantial clinical importance. More mechanistic studies are needed to carefully quantify how much of early IFN levels is needed to bypass the viral evasion mechanism and prevent its further replication and dissemination to lower airways and the rest of the body.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».