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Enregistrement W4309632154 · doi:10.1016/j.heliyon.2022.e11724

Airways tissue expression of type I interferons and their stimulated genes is higher in children than adults

2022· article· en· W4309632154 sur OpenAlexaff
Narjes Saheb Sharif‐Askari, Fatemeh Saheb Sharif‐Askari, Shirin Hafezi, Zaina Kalaji, Mohamad‐Hani Temsah, Saleh Al‐Muhsen, Habiba Alsafar, Qutayba Hamid, Rabih Halwani

Notice bibliographique

RevueHeliyon · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRespiratory viral infections research
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesUniversity of SharjahAl Jalila Foundation
Mots-clésInterferonImmunologyIn silicoInnate immune systemBiologyImmune systemRespiratory tractTranscriptomeRespiratory systemGeneViral loadVirusGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There is emerging evidence that age-dependent differences in susceptibility to severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) correlate with stronger innate immune response in the upper respiratory tract in children compared to adults. The efficient induction of interferon (IFN) alpha and beta (α and β) signaling, and interferon-stimulated genes (ISGs) is fundamental to the host antiviral response. In-silico transcriptomic analyses was conducted to determine the expression levels of IFN α/β pathway genes as well as 524 human ISGs in upper and lower airways of children and adults at baseline and post respiratory infections including coronavirus disease 2019 (COVID-19). To validate our in-silico analysis, we conducted qRT-PCR to measure ISGs levels in children and adult's nasal epithelial samples. At baseline, children had significantly higher levels of IFN α/β and ISGs genes compared to adults. More distinction was also seen in bronchial compared to nasal basal levels. Children nasal epithelial cells exhibited superior antiviral IFN α/β and associated ISGs response following ex-vivo poly (I:C) treatment model, and in clinical samples of SARS-CoV-2 infected patients. This was also confirmed in nasal epithelial samples using qRT-PCR validation. No gender-based difference in type I IFN levels across both age groups were observed. Understanding the biological basis for children resistance against severe COVID-19 is a challenge that has substantial clinical importance. More mechanistic studies are needed to carefully quantify how much of early IFN levels is needed to bypass the viral evasion mechanism and prevent its further replication and dissemination to lower airways and the rest of the body.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,068
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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