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Enregistrement W4309721430 · doi:10.1098/rspb.2022.1113

Why don't we share data and code? Perceived barriers and benefits to public archiving practices

2022· article· en· W4309721430 sur OpenAlexaff
Dylan Gomes, Patrice Pottier, Robert Crystal‐Ornelas, Emma J. Hudgins, Vivienne Foroughirad, Luna L. Sánchez‐Reyes, Rachel Turba, Paula Andrea Martinez, David Moreau, Michael G. Bertram, Cooper Smout, Kaitlyn M. Gaynor

Notice bibliographique

RevueProceedings of the Royal Society B Biological Sciences · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueResearch Data Management Practices
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaCarleton University
Organismes subventionnairesBiological and Environmental ResearchOffice of ScienceNational Center for Ecological Analysis and SynthesisNational Academy of SciencesSvenska Forskningsrådet FormasKempestiftelsernaUniversity of New South Wales
Mots-clésCode (set theory)IncentiveOpen scienceData scienceCategorizationData sharingReuseOpen dataValue (mathematics)Computer sciencePublic relationsKnowledge managementInternet privacyBusinessPolitical scienceWorld Wide WebEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The biological sciences community is increasingly recognizing the value of open, reproducible and transparent research practices for science and society at large. Despite this recognition, many researchers fail to share their data and code publicly. This pattern may arise from knowledge barriers about how to archive data and code, concerns about its reuse, and misaligned career incentives. Here, we define, categorize and discuss barriers to data and code sharing that are relevant to many research fields. We explore how real and perceived barriers might be overcome or reframed in the light of the benefits relative to costs. By elucidating these barriers and the contexts in which they arise, we can take steps to mitigate them and align our actions with the goals of open science, both as individual scientists and as a scientific community.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,139
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,313
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Science ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Reproductibilité · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Qualitatif · Signal consensuel: Qualitatif
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,996
Score d'incertitude au seuil0,737

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1390,313
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0100,019
Communication savante0,0160,024
Science ouverte0,0040,013
Intégrité de la recherche0,0050,008
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,187
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,159 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeQualitatif
DomaineReproductibilité
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations156
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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