Assessment of an enhanced COVID-19 case and contact management protocol in controlling a SARS-CoV-2 Alpha (B.1.1.7) variant outbreak on a construction site
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: To control the spread of SARS-CoV-2 variants of concern (VOCs), Kingston, Frontenac, and Lennox & Addington (KFL&A) Public Health implemented a more stringent COVID-19 case and contact management (CCM) protocol than what was used across Ontario at the time. We describe epidemiological data and public health measures employed during one of the largest COVID-19 outbreaks in the KFL&A region at the time, caused by the SARS-CoV-2 Alpha (B.1.1.7) VOC, to assess this enhanced protocol. METHODS: We obtained line lists of workers associated with the construction site outbreak, and subsequent cases and contacts from case investigators. Case testing, mutation status, and whole genome sequencing were conducted by Public Health Ontario Laboratories. RESULTS: From 409 high-risk contacts of the outbreak, 109 (27%) developed COVID-19. Three generations of spread were associated with the outbreak, affecting seven public health regions across three provinces. Using an enhanced approach to the CCM, KFL&A Public Health caught 15 cases that could have been missed by standard provincial protocols. CONCLUSIONS: Rapid initial spread within the construction site produced a relatively high attack rate among workers (26%) and their immediate contacts (34%). KFL&A Public Health's implementation of stringent CCM protocols and fast testing turn-around time effectively curbed the spread of the disease in subsequent generations - illustrated by the large reduction in attack rate (34%-14%) and cases (50-10) between the second and third generations. Lessons learned from this analysis may inform guidance on the CCM for future SARS-CoV-2 VOCs as well as other highly transmissible communicable diseases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,077 | 0,086 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».