Structural and functional insights into iron acquisition from lactoferrin and transferrin in Gram-negative bacterial pathogens
Notice bibliographique
Résumé
Iron is an essential element for various lifeforms but is largely insoluble due to the oxygenation of Earth's atmosphere and oceans during the Proterozoic era. Metazoans evolved iron transport glycoproteins, like transferrin (Tf) and lactoferrin (Lf), to keep iron in a non-toxic, usable form, while maintaining a low free iron concentration in the body that is unable to sustain bacterial growth. To survive on the mucosal surfaces of the human respiratory tract where it exclusively resides, the Gram-negative bacterial pathogen Moraxella catarrhalis utilizes surface receptors for acquiring iron directly from human Tf and Lf. The receptors are comprised of a surface lipoprotein to capture iron-loaded Tf or Lf and deliver it to a TonB-dependent transporter (TBDT) for removal of iron and transport across the outer membrane. The subsequent transport of iron into the cell is normally mediated by a periplasmic iron-binding protein and inner membrane transport complex, which has yet to be determined for Moraxella catarrhalis. We identified two potential periplasm to cytoplasm transport systems and performed structural and functional studies with the periplasmic binding proteins (FbpA and AfeA) to evaluate their role. Growth studies with strains deleted in the fbpA or afeA gene demonstrated that FbpA, but not AfeA, was required for growth on human Tf or Lf. The crystal structure of FbpA with bound iron in the open conformation was obtained, identifying three tyrosine ligands that were required for growth on Tf or Lf. Computational modeling of the YfeA homologue, AfeA, revealed conserved residues involved in metal binding.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».