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Enregistrement W4309926397 · doi:10.3389/fmolb.2022.994239

Editorial: Multi-omics: Trends and applications in clinical research

2022· editorial· en· W4309926397 sur OpenAlexaff
Alessandra Sussulini, Jianguo Xia, Matej Orešič

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Molecular Biosciences · 2022
Typeeditorial
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMetabolomicsOmicsData scienceComputational biologyBiologyComputer scienceBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Omics-based studies have substantially contributed to the emergence and progress of systems biology over the past decades. Each layer of omics data provides a unique perspective on the biological system at a particular molecular level (e.g., RNA, proteins, metabolites), with all levels being involved in different yet inter-related biological processes. However, data at any individual omics level cannot fully explain how these different multi-layered biological processes interact and how they lead to emergence of complex phenotypes. To answer these questions, multi-omics strategies have been increasingly employed to obtain a broader view of the interactions that connect genotypes to phenotypes of interest. Omics data integration can provide a more reliable and holistic picture of the biochemistry and dynamics of biological systems, as compared to data from any omics layer alone. Multi-omics is also a powerful tool for discovery and prioritization of biomarkers, which is a topic of high interest in clinical research. To understand biological processes within the systems biology context, various statistical and computational tools are typically employed in multi-omics studies. In clinical studies, data integration across different omics is a promising tool for the early detection of various diseases, as well as for evaluating the efficacy of different treatments. Therefore, the aim of this Research Topic was to cover advances in the multi-omics research field with consideration of clinical applications. This Research Topic of five articles involves multi-omics studies of different diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: Éditorial
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,347 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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