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Enregistrement W4310102582 · doi:10.14785/lymphosign-2022-0014

Whole exome sequencing identifies causative compound heterozygous variants in <i>PRF1</i> in late-onset familial hemophagocytic lymphohistiocytosis

2022· article· en· W4310102582 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.

Notice bibliographique

RevueLymphoSign Journal · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutoimmune and Inflammatory Disorders Research
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHemophagocytic lymphohistiocytosisExome sequencingCompound heterozygosityMissense mutationCytopeniaExomeImmunologyMedicineImmune dysregulationPancytopeniaHepatosplenomegalyPerforinDiseaseBiologyImmune systemMutationGeneticsGeneInternal medicineCD8Bone marrow

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Hemophagocytic lymphohistiocytosis (HLH) is a rare and life-threatening disease in which cells of the immune system are overactivated, leading to uncontrolled inflammation and tissue destruction. Inherited or familial forms of HLH (FHL) are further classified into FHL1 to 5, based on the underlying genetic etiology. The most common form, FHL2, is associated with mutations in the PRF1 gene encoding perforin, a pore-forming glycoprotein required for natural killer and cytotoxic T cell-mediated apoptosis. Importantly, diagnosis of FHL can be challenging, particularly in late-onset cases in which presentation is delayed beyond the first years of life. Aim: We report the essential role of whole exome sequencing in the diagnostic work-up of a patient with complex, late-onset FHL. Methods: A comprehensive retrospective chart review was performed. Results: Our patient presented at 11 years of age with recurrent fever, hepatosplenomegaly, and pancytopenia. In the following years, she was admitted to hospital on multiple occasions, including twice for febrile neutropenia, and once for febrile cytopenia. Serial immune evaluation revealed features of immune dysregulation. While HLH was suspected, she did not fulfil the diagnostic criteria. Initial genetic work-up involving a targeted primary immunodeficiency gene panel identified only a single novel variant of uncertain significance, c.T374C (p.I125T) in PRF1. Subsequently, research-based whole exome sequencing was performed which revealed a second variant, c.C272T (p.A91V), in the same gene. The expanded genetic findings, a set of compound heterozygous missense mutations in PRF1, strengthened the diagnosis of FHL. She later fulfilled the diagnostic criteria for HLH. Conclusion: Whole exome sequencing identified compound heterozygous mutations in the PRF1 gene in a patient with late-onset FHL. Statement of Novelty: We report the use of whole exome sequencing to identify compound heterozygous mutations in PRF1, including a novel p.I125T variant not previously identified in FHL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,434
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle