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Enregistrement W4310102605 · doi:10.14785/lymphosign-2022-0013

Heterogeneous phenotype of autoinflammatory disease in a patient with mutations in <i>NOD2</i> and <i>MEFV</i> genes

2022· article· en· W4310102605 sur OpenAlexaffvenue
Laura Edith Abrego Fuentes, Irene Chair, Peter Vadas, Chaim M. Roifman

Notice bibliographique

RevueLymphoSign Journal · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammasome and immune disorders
Établissements canadiensSt. Michael's HospitalUniversity of British ColumbiaHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMEFVFamilial Mediterranean feverNOD2MedicineGeneticsCompound heterozygosityDiseaseGene mutationPhenotypeBiologyMutationGeneInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Autoinflammatory diseases are a genetically heterogeneous group of conditions characterized by excessive activation of the innate immune system. They frequently present with overlapping features, particularly in cases of digenic or polygenic inheritance. The most common cause of autoinflammation arises from causative variants in the MEFV gene, responsible for familial Mediterranean fever. Clinical features include recurrent episodes of fever with serositis and amyloidosis. Individuals with variants in MEFV that present atypically with heterogeneous autoinflammatory features have also been described. Notably, gene modifiers of MEFV, such as NOD2 encoding an intracellular bacterial sensor, can result in more severe disease. NOD2 underlies a number of autoinflammatory and immunodeficiency conditions, including Blau syndrome. To date, Blau syndrome has not been described in the context of MEFV. Aim: To expand the presentation and phenotype of autoinflammatory disease associated with defects in the NOD2 and MEFV genes. Methods: A retrospective review of the patient’s chart was performed, including family history, medical history, immune laboratory evaluation, and genetics. Results: We describe here a 68-year-old male with a remarkable medical history since childhood of skin rash, erythroderma, recurrent infections, autoinflammation, arthritis, uveitis, and malignancy. A significant family history of cancer and autoinflammation was noted. Genetic work-up involving a 17-gene autoinflammatory panel revealed 3 heterozygous variants of uncertain significance, 2 of which were present in the MEFV gene and one in the NOD2 gene. His features were consistent with an overlapping phenotype of Blau syndrome and atypical FMF. Conclusion: Heterozygous variants in NOD2 and MEFV can result in a spectrum of autoinflammatory disorders with a heterogeneous phenotype. The NOD2 variant identified in our patient has not previously been associated with Blau syndrome. Statement of Novelty: We describe a patient harbouring heterozygous mutations in the MEFV and NOD2 genes marked by recurrent childhood infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,183
Écart entre enseignants0,180 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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