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Enregistrement W4310262032 · doi:10.1177/00220345221132268

Novel Genetic Determinants of Dental Maturation in Children

2022· review· en· W4310262032 sur OpenAlexaff
Olja Grgić, Vid Prijatelj, Amel Dudakovic, Brunilda Dhamo, Katerina Trajanoska, Claire Monnereau, Maša Zrimšek, Kaare M. Gautvik, Sjur Reppe, Emi Shimizu, Simon Haworth, Nicholas J. Timpson, Vincent W. V. Jaddoe, Marjo‐Riitta Järvelin, David M. Evans, André G. Uitterlinden, Edwin M. Ongkosuwito, André J. van Wijnen, Carolina Medina‐Gómez, Fernando Rivadeneira, Eppo B. Wolvius

Notice bibliographique

RevueJournal of Dental Research · 2022
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Syndromes and Imprinting
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesMedical Research CouncilUniversity of BristolErasmus Medisch CentrumZonMwNational Institutes of HealthFoundation for the National Institutes of HealthCancer Research UKNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekWellcome TrustErasmus Universiteit RotterdamNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésGenome-wide association studyPopulation stratificationCraniofacialPopulationGeneticsAlleleGenetic associationMedicineBiologyGenotypeGeneSingle-nucleotide polymorphism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dental occlusion requires harmonious development of teeth, jaws, and other elements of the craniofacial complex, which are regulated by environmental and genetic factors. We performed the first genome-wide association study (GWAS) on dental development (DD) using the Demirjian radiographic method. Radiographic assessments from participants of the Generation R Study (primary study population, N 1 = 2,793; mean age of 9.8 y) were correlated with ~30 million genetic variants while adjusting for age, sex, and genomic principal components (proxy for population stratification). Variants associated with DD at genome-wide significant level ( P < 5 × 10 −8 ) mapped to 16q12.2 ( IRX5) (lead variant rs3922616, B = 0.16; P = 2.2 × 10 −8 ). We used Fisher’s combined probability tests weighted by sample size to perform a meta-analysis ( N = 14,805) combining radiographic DD at a mean age of 9.8 y from Generation R with data from a previous GWAS ( N 2 = 12,012) on number of teeth (NT) in infants used as proxy of DD at a mean age of 9.8 y (including the ALSPAC and NFBC1966). This GWAS meta-analysis revealed 3 novel loci mapping to 7p15.3 ( IGF2BP3: P = 3.2 × 10 −8 ), 14q13.3 ( PAX9: P = 1.9 × 10 −8 ), and 16q12.2 ( IRX5: P = 1.2 × 10 −9 ) and validated 8 previously reported NT loci. A polygenic allele score constructed from these 11 loci was associated with radiographic DD in an independent Generation R set of children ( N = 703; B = 0.05, P = 0.004). Furthermore, profiling of the identified genes across an atlas of murine and human stem cells observed expression in the cells involved in the formation of bone and/or dental tissues (>0.3 frequency per kilobase of transcript per million mapped reads), likely reflecting functional specialization. Our findings provide biological insight into the polygenic architecture of the pediatric dental maturation process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,980
Score d'incertitude au seuil0,616

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,416
Écart entre enseignants0,336 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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